Mesopolyploid events in the evolution of Brassicaceae
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-10159S
Alternative language
Project name in Czech
Role mesopolyploidie v evoluci čeledi Brassicaceae
Annotation in Czech
Celogenomové duplikace (polyploidie) hrají u rostlin klíčovou roli při vzniku genetické diversity. Na rozdíl od paleopolyploidie, evolučně mladší mesopolyploidní duplikace jsou detekovatelné pomocí srovnávací cytogenetiky a genomiky. Naše předběžná cytogenetická analýza bona fide diploidních druhů ukázala, že v čel. Brassicaceae se vyskytlo několik mesopolyploidních duplikací. Cílem projektu je identifikovat a charakterizovat mesopolyploidní duplikace v čel. Brassicaceae pomocí srovnávacího malování chromosomů a sekvenční analýzy transkriptomu. Budou rekonstruovány ancestrální subgenomy mesopolyploidních taxonů, stejně jako proces genomové diploidizace. Dále budou zkoumány přestavby karyotypu duplikovaných genomů a mechanismy redukce počtu chromosomů u quasi-diploidních druhů. Sekvenční analýza celogenomového transkriptomu bude použita k potvrzení cytogenetických dat a k analýze fylogenetické pozice celogenomových duplikací. Bude testováno zda mesopolyploidní duplikace měly přímý impakt na adaptivní radiaci a druhovou rozmanitost mesopolyploidních taxonů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Solution of the ambitious project considerably contributed to characterization of whole-genome duplications in Brassicaceae, to elucidation of their roles in evolution and adaptation of plant species to changing ecological conditions. Results were published in prestigious journals of „Plant Science“ (2 papers in Plant Cell), another manuscript has been accepted for publication in Plant Journal.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Apr 25, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 10, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
6,835 thou. CZK
Public financial support
6,835 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK