Genomic substrates of chromosome rearrangements and dysploidy during plant evolutionary diversification
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
21-07748L
Alternative language
Project name in Czech
Genomické substráty chromosomových přestaveb a dysploidie během evoluční diversifikace rostlin
Annotation in Czech
Divergence genomů je většinou spojená s restrukturalizačními procesy, jako jsou ztráta genů, chromosomové přestavby (ChP) a aktivita transponovatelných elementů. Výsledkem některých ChP je redukce duplikovaných chromosomových sad (redukční dysploidie). Mechanismy, molekulární charakteristiky a evoluční signifikance těchto genomových reorganizací, stejně jako úloha redukční dysploidie při vzniku druhu a během kladogeneze, zůstávají neprozkoumány. Srovnávací studie blízce příbuzných druhů s rozdílným stupněm redukční dysploidie jsou nezbytné k pochopení příčin a následků redukčních dysploidií. Plánujeme sekvenovat, analyzovat a porovnat devět genomů rodu Biscutella (dvojštítek, Brassicaceae) s rozdílnou velikostí genomu a počtem chromosomů. Celogenomové sekvence nám umožní srovnávací analýzy kvantifikující malé vs. rozsáhlé restrukturalizace ovlivňující kódující vs. nekódující frakce genomů. Analýzou významu duplikace vs. ztráty genů/transponovatelných elementů pro organizaci genomu zjistíme jak dysploidní ChP příspívají k druhové divergenci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
May 4, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GF-R
Data delivery date
May 21, 2024
Finance
Total approved costs
12,160 thou. CZK
Public financial support
11,821 thou. CZK
Other public sources
339 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK