Study of genomic variability of phytopathogens - base for their detection and eradication
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Scheme of targeted research and development support
Call for proposals
SAV0-SS2000
Main participants
Ústav molekulární biologie rostlin AV ČR
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium variability genomů fytopatogenů jako základ pro metody jejich detekce a eradikace
Annotation in Czech
Pokrok v molekulární biologii posledních let otevřel nové metodické přístupy k diagnostice, k přesnému zmapování výskytu i ke studiu molekulární organizace fytopatogenů. Otevřela se i možnost navození rezistence prostřednitvím technologií využívajích transgeny odvozené z genomových sekvencí jednotlivých fytopatogenů, které povedou k jejich účinné eradikace. Na druhou stranu současný vývoj v této oblasti vedl k odhalení vysokého stupně přirozené variability genomů patogenů a v souvisloti s tím znovu nastolil jak otázky spolehlivosti detekčních systémů, tak nutnost analýzy variability potogenních domén či cílových sekvencí vhodných ro technologie indukované rezistence. Projekt navrhuje podrobnou analýzu genomů významných patogenů bramboru (viroid vřetenovitosti hlíz, virus Y, Clavibacter), chmele (latentní viroid, virus mosaiky jabloně) a ovocných dřevin (fytoplasmy) s cílem vypracovat spolehlivý metodický základ pro jejich diagnostiku, klasifikaci a další eradikaci.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Several tens of viroid, viral, phytoplasmal and bacterial nucleotide sequences were added to the world databases. Collection of isolates and bank of clones applicable in further use and research were prepared. New detection methods were developed.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/AV0/AV05IB/U/N/2:1
Data delivery date
Jun 17, 2005
Finance
Total approved costs
9,451 thou. CZK
Public financial support
3,950 thou. CZK
Other public sources
5,501 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK