Applications of chemical structural probes and electroanalytical methods in DNA damage detection. Development of DNA sensors.
Project goals
In this project we propose to employ chemical probing of DNA structure, in connection with biochemical methods and electrochemical detection, in analysis of DNA damage. Monitoring of DNA-damaging pollutants in the environment, together with analysis of damage to cellular DNA, belong to important steps in prevention of serious diseases such as cancer. We propose to use osmium tetroxide complexes (Os,L) in detection of DNA damage induced by different chemical and physical agents. DNA-Os,L adducts will bedetected electrochemically, or using enzyme-linked immunoassay with electrochemical detection. In a new approach, magnetic beads will be used as carrier surface for DNA exposed to DNA damaging agents and/or to capture and purify damaged DNA from reactionmixtures (cell lysates) for subsequent electrochemical analysis. To gain the best response, currently used elekctrochemical techniques will be improved and optimized, and simple electrochemical DNA biosensors will be designed.
Keywords
DNA damage detectionelekctroanalytical methodschemical probes of DNA structuremagnetoseparation techniquesDNA biosensors
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 1 (SAV02003-XJ)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Využití chemických strukturních sond a elektroanalytických metod při detekci poškození DNA. Vývoj DNA senzorů.
Annotation in Czech
V tomto projektu navrhujeme využít chemických strukturníchsond, ve spojení s biochemickými metodami a s elektrochemickou detekcí, při analýze poškození DNA.Monitorování látek poškozujících DNA v prostředí, spolu s nalýzou poškození buněčné DNA, patří k důležitým krokům při prevenci vážných oenmocnění jako je rakovina. Navrhujeme využít komplexů oxidu osmičelého (Os,L) pro detekci poškození DNA indukovaného různými chemickými a fyzikálními činidly. Adukty DNA s Os,L budou detekovány elektrochemicky nebopomocí enzymové imunoanalýzy s elektrochemickou detekcí. V rámci nového přístupu budou využity magnetické mikročástice jako nosičový povrch pro DNA vystavenou poškozujícím činidlům, nbebo pro zachycení a purifikaci poškozené DNA z reakčních směsí (buněčných lyzátů) před její elektrochemickou analýzou. Pro dosažení co nejlepších signálů budou v současnosti využívané elektrochemické metody vylepšovány a optimalizovány, a budou navrženy jednoduché elektrochemické DNA biosenzory.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CG - Electrochemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Labeling by osmium tetroxide complex was used in development of method for the length of triplet repeat expansion determination in combination with magnetoseparation technique and in combination with enzymatic cleavag for DNA base damage detection.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-AV0-KJ-U/07:5
Data delivery date
Feb 12, 2014
Finance
Total approved costs
2,052 thou. CZK
Public financial support
1,212 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 052 CZK thou.
Public support
1 212 CZK thou.
59%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
CG - Electrochemistry
Solution period
01. 01. 2003 - 01. 01. 2005