Electrochemical tools for detection of point mutations and polymorphisms in DNA
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 8 (SGA02008GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
203/08/P598
Alternative language
Project name in Czech
Elektrochemické nástroje pro detekci mutací a polymorfismů v DNA
Annotation in Czech
V rámci navrhovaného projektu chceme navázat na náš předchozí výzkum elektrochemických nástrojů pro detekci hybridizace DNA. Budeme modifikovat oligonukleotidy různými elektrochemicky aktivními značkami (zejména na bázi kovových komplexů), analyzovat jejich elektrochemické chování a využijeme je jako signální sondy při hybridizaci DNA. Dále se budeme zabývat využitím komplexů Os,L jako chemických sond pro chybně spárované a nespárované baze v heteroduplexech DNA a na tomto principu navrhneme metodu detekce bodových mutací v DNA. Pro naše účely budeme optimalizovat podmínky pro manipulaci s duplexy obsahujícími chybné páry a abazická místa a podmínky elektrochemické nebo imunochemické detekce modifikovaných bazí. Při detekci využijeme tzv. dvoupovrchovéstrategie, kdy proces hybridizace DNA probíhá na samostatném povrchu - paramagnetických kuličkách. Toto uspořádání dovoluje precisní "vyladění" podmínek jak pro hybridizaci tak pro detekci. Předpokládáme, že získané poznatky budou následně
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CG - Electrochemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project broadens possibilities of using reaction mixture of osmium tetroxide and nitrogenous ligands for biopolymers labeling. There were obtained new insights into reaction mechanism and modification reaction A) We show that reactive mixtureOsO4 and bipyridine is capable of reaction with unpaired / mispaired T even when it is surrounded by adjacent double-strand DNA stretch
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-GA0-GP-U/04:3
Data delivery date
Mar 20, 2015
Finance
Total approved costs
1,404 thou. CZK
Public financial support
1,404 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK