Mutants of tumor supressor protein p53 and regulation of thei DNA binding activity
Project goals
The p53 tumor suppressor protein plays a critical role in the cellular response to DNA damage by regulating the expression of genes involved in controlling DNA repair, cell proliferation and apoptosis. Mutants of p53 protein are found in more than 50% ofcancer cases. Detailed study of p53 mutants, which are presented the most often in human tumors, is proposed in this project. We will study especially p53 mutant binding properties to natural binding sequences in linear and supercoiled DNA. We will prepare expression vectors of the p53 mutants. By means of gel shift retardation method we will analyze protein/DNA complexes in agarose and/or acrylamide gel. We will examine the possibility of activation p53 mutants to DNA binding using specific phosphorylation, monoclonal antibodies and binding with other p53 interacting proteins.
Keywords
mutants p53DNA bindingp53/DNA binding activationsuperhalical DNAregulation of p53 mutants binding activity
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 3 (SAV02005-J)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB500040502
Alternative language
Project name in Czech
Mutanty nádorového supresoru proteinu p53 a regulace jejich DNA vazebné aktivity
Annotation in Czech
Nádorový supresor protein p53 hraje kritickou úlohu v buněčné odpovědi na poškození DNA regulací exprese genů řídících buněčnou proliferaci a programovanou buněčnou smrt. Protein p53 je mutovaný ve více než 50% případů nádorového bujení u člověka. V našem projektu plánujeme detailní studii mutantů proteinu p53, které se vyskytují nejčastěji u lidských zhoubných nádorů. Zaměříme se zejména na vazbu mutantních proteinů p53 k přirozeným cílovým sekvencím v lineární a superhelikální DNA. Připravíme expresnívektory mutantů proteinu p53 a pomocí retardace komplexů proteinu s DNA budeme analyzovat vazebné vlastnosti jednotlivých mutantů proteinu p53. Budeme zkoumat možnosti aktivace mutantů proteinu p53 zejména pomocí specifických fosforylací, vazby monoklonálních protilátek a vazby dalších proteinů interagujících s proteinem p53.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
FD - Oncology and haematology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30204 - Oncology
30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We analyzed wild-type and mutant p53 proteins. The p53 consensus sequences in longer DNAs are better targets than the same sequences in shorter DNAs. We investigated the effect of temperature; some mutants bind DNA and adopt a wt conformation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 1, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-AV0-KJ-U/02:2
Data delivery date
Apr 3, 2009
Finance
Total approved costs
1,230 thou. CZK
Public financial support
1,230 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
1 230 CZK thou.
Public support
1 230 CZK thou.
100%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2005 - 01. 12. 2007