Quantification and localization of maternal mRNAs in early development of Xenopus
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 4 (SAV02006-B)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB500520601
Alternative language
Project name in Czech
Kvantifikace a lokalizace maternálních mRNA v časném vývoji drápatky (Xenopus)
Annotation in Czech
Buněčná diferenciace během časného vývoje je děj plně závislý na množství a distribuci jednotlivých proteinů a mRNA v buňkách. U savců je kvantifikace mRNA omezena malým množstvím RNA v buňce. Časné embryonální buňky a vajíčka drápatky (Xenopus) obsahujívšak dostatečné množství RNA pro rozsáhlá měření. Z tohoto důvodu navrhuji pomocí kvantitativní PCR stanovit hladiny mRNA 40 různých maternálních genů v jednotlivých buňkách od vajíčka po 16-ti buňková embrya. Z výsledků bude sestavena 3D mapa genové exprese a distribuce mRNA v jednotlivých buňkách embryí. Z této mapy bude možno odvodit spojení distribuce mRNA s vývojovými pochody a tím s funkcí genu v časném vývoji. Následně bude mapa sloužit jako předloha pro ostatní maternální geny a pro předpověď jejich účinku. Funkce těchto genů bude dále studována pomocí nadprodukce nebo inhibice.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Novel method for spatial expression profiling, called qPCR tomography, was developed. Xenopus laevis oocytes and early embryos were used to create spatial expression map of maternal genes. Only two groups of localization patterns were found.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 1, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-AV0-KJ-U/02:2
Data delivery date
Apr 3, 2009
Finance
Total approved costs
720 thou. CZK
Public financial support
720 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK