MicroRNA expression during early development of Xenopus laevis and mRNA degradation
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA500970904
Alternative language
Project name in Czech
Exprese miRNA během časného vývoje drápatky a degradace mRNA
Annotation in Czech
Buněčný osud a diferenciace jsou závislé na přesné a regulované expresi mRNA a proteinů a na jejich degradaci. Exprese mRNA byla široce studována, avšak mechanismy rozpadu nejsou známy během vývoje. Byly popsány tři různé mechanismy mRNA rozpadu: 5'-3' a3'-5' exonukleolytické štěpení a endonukleázové štěpení. Ve většině případů se myslí, že mRNA rozpad je stimulován miRNA. Naším cílem je stadium lokalizace miRNA během časného vývoje a jejich role v mRNA rozpadu. Naším modelovým organismem je žába, drápatka (Xenopus), vybraná kvůli obrovské velikosti vajíček a značnému množství embryí o stejném původu. S použitím qPCR a hlavně nové qPCR tomografie, kterou jsme zavedli, budeme studovat specifický rozpad mRNA od 5' konce, v centru a od 3' oblasti maternální mRNA během časných vývojových stádií, kdy de novo transkripce ještě není započata. Výsledky budou porovnány s mRNA degradací postmortem.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Detection of mRNA´ degradation was optimized for degradation in early development of Xenopus laevis and tissues post mortem. RNA spike was designed like a control of RNA´ degradation and also like a marker of reverse transcription and qPCR inhition.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 18, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
2,820 thou. CZK
Public financial support
2,820 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK