Biosynthesis of asukamycin polyketide chains: Prospects for hybrid antibotics
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 1 (SAV02003-XJ)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Biosyntéza polyketidových řetězců asukamycinu: Možnosti tvorby hybridních antibiotik
Annotation in Czech
Manumycinová antibiotika, produkovaná některými kmeny streptomycet, jsou studována především pro wvé potenciální protinádorové a protizánětlivé účinky. Tyto metabolity jsou charakteristické přitomností dvou cyklických uhlíkových jednotek spojených dvěmapolyketidovými řetězci. Jejich biosyntetická dráha byla již navržena na základě experimentů s radioaktivně značenými prekurzory. Geny, které ji kódují, však zatím příliš studovány nebyly. Cílem této práce by v prvé řadě mělo být vymezení genového shlukuzodpovědného za biosyntézu asukamycinu (na základě jeho částečné znalosti) a jeho porovnání s manumycinovým genovým shlukem, a to se zaměřením na biosyntézu polyketidových řetězců. V návaznosti na získané výsledky pak otestování možností řízené biosyntézy nových hybridních asukamycinových derivátů pomocí genových manipulací s geny kódujícími příslušné polyketidsyntasy u obou produkčních mikroorganismů, Streptomyces parvulus a Streptomyces nodosus var. asukaensis.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The results include identification and sequencing of the manumycin gene cluster in S. parvulus Tű64. Based on the comparison with the asukamycin genes, the polyketide chain synthesis model was created and constructs for its verification were prepared.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-AV0-KJ-U/07:5
Data delivery date
Feb 12, 2014
Finance
Total approved costs
1,267 thou. CZK
Public financial support
1,109 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK