Phylogenetic relationships within Myxosporea inferred from combined analysis of ribosomal and protein gene sequences: evolution of important fish parasites
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 5 (SAV02007-B)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB600960701
Alternative language
Project name in Czech
Fylogenetické vztahy v rámci skupiny Myxosporea na základě kombinované analýzy sekvencí ribosomálních a proteinových genů: evoluce významné skupiny rybích parazitů
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na fylogenetickou analýzu myxosporeí - ekonomicky a fylogeneticky významné skupiny primitivních metazoí infikující ryby. Hlavním cílem bude vytvoření rozsáhlého datasetu, který zahrne ribosomální (SSU a LSU rDNA) a proteinové geny (HSP70, MHC-II a EF2). Kombinovaná analýza muže poskytnout informaci pro vyřešení větvení, které v analýze založené pouze na samotném SSU rRNA genu nebylo výrazně podpořeno. Samostatná analýza proteinových genů bude porovnána s analýzou ribosomálních genů. Předpokládáme, že nová data přispějí k lepšímu porozumění vztahu mezi jednotlivými rody myxosporeí. Fylogenetickou analýzu kombinovaných dat provedeme pomocí Bayesovské metody, metod maximální parsimonie a maximální pravděpodobnosti.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We supported single SSU rDNA based phylogeny of Myxosporea by LSU rDNA and EF2 gene analyses. We suggested supposed evolution of morphological and bionomical characters of Myxozoa.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-AV0-KJ-U/03:3
Data delivery date
Jun 14, 2011
Finance
Total approved costs
1,062 thou. CZK
Public financial support
1,062 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK