A new tool for structural biology: Combination of high resolution mass spectrometry, chemical cross-linking and H/D exchange
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
COST CZ
Call for proposals
COST CZ 5 (SMSM2015LD5)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-33315/2015-1
Alternative language
Project name in Czech
Nový nástroj strukturní biologie: Kombinace hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením, chemické zesítění a H/D
Annotation in Czech
Prvotním cílem projektu je podpora strukturně proteomické komunity, která v rámci COST BM1403 zajistí tvorbu a sdílení nových aplikací, postupů a programů. Recipročně bude získán přístup k technologiím, které nejsou v České republice dostupné. Získaná kompetence členů týmu uchazeče bude přenesena do národní komunity. V rámci projektu bude pracoviště uchazeče řešit vybrané vlastní odborné okruhy, které zapadají do COST aktivity (metodiky a aplikace). Jedná se o produkci a imobilizaci kyselých proteas z rostlin rodu Nepenthes a tvorbu programů na zpracování hmotnostně spektrometrických analýz, které zjednoduší, zrychlí a zefektivní práci celé vědecké komunity.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - another secondary branch
CD - Macromolecular chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10404 - Polymer science<br>10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Research team developed new effective software tools for interpretation of mass spectrometric data from hydrogen/deuterieum (DeuTex) and chemical cross-linking (LinX) experiments.
Solution timeline
Realization period - beginning
Oct 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 24, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-MSM-LD-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2018
Finance
Total approved costs
1,471 thou. CZK
Public financial support
1,471 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK