Mesoscopic Modeling of Protein-Surface Interactions
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 2 (SMSM2012LH2)
Main participants
Ústav chemických procesů AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-6805/2013-311
Alternative language
Project name in Czech
Mesoskopické modelování interakce proteinů s povrchy
Annotation in Czech
Cílem projektu je přispět k základnímu pochopení mechanismu adsorpce/desorpce proteinů na homogenních a heterogenních površích. Pomocí mesoskopických simulací založených na disipativní částicové dynamice bude systematicky studován efekt tvaru, velikostia hydrofobicity/hydrofilicity proteinů na jejich adsorpční kinetiku. Mesoskopické modely proteinů a povrchů budou navrženy na základě molekulárních simulací jednotlivých proteinů ve vodě a v blízkosti stěn pomocí mapování z atomární na mesoskopickou úroveň. Mesoskopické modelování bude doplněno makroskopickým modelováním založeným na kinetických modelech adsorpčních procesů a výsledky mesoskopických simulací budou přímo srovnány s experimentálními daty.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
BJ - Thermodynamics
CEP - another secondary branch
BO - Biophysics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10610 - Biophysics<br>20303 - Thermodynamics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
"Particle-based modelling of mucins and their mapping on mesoscale level were carried out. The results were published in three IF journals and presented at the FOMMS2015 conference. During PI’s stay in USA, seminars were organized and PI became a supervisor of MSc theses."
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Oct 9, 2017
Finance
Total approved costs
2,433 thou. CZK
Public financial support
2,433 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK