The Role of HIV Fitness on Disease Progression in the Absence of Antiretroviral Treatment
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
NAVRAT
Call for proposals
NÁVRAT 1 (SMSM2012LK1)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-8056/2012
Alternative language
Project name in Czech
Role replikační zdatnosti HIV na průběh nemoci u pacientů bez antiretrovirové léčby
Annotation in Czech
Průběh nemoci u pacientů infikovaných virem lidské imunodeficience (HIV) je velmi různorodý a závisí na celé řadě jak genetických a imunologických faktorů hostitele tak na charakterových rysech HIV. Jedním z těchto rysů je replikační zdatnost viru, tak zvaná replikační fitness, která bývá spojována s virulencí, patogenitou, resistentními mutacemi a progresí nemoci. Dle vývoje nemoci rozdělujeme pacienty na rychlé progresory, chronické progresory a na pacienty dlouhodobě neprogredující, tzv. kontrolory.V tomto návrhu chceme (i) stanovit metodu pro měření replikační fitness u terapeuticky naivních pacientů, (ii) zkoumat podíl virových genů na replikační fitness HIV u chronických progresorů a kontrolorů a (iii) nakonec využít těchto výsledků pro pilotnístudii korelace replikační fitness HIV s průběhem onemocnění u pacientů bez antiretrovirové léčby. Mimoto budeme analyzovat genetické a imunologické faktory hostitele, které jsou spojovány s velmi pomalým postupem nemoci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The replicative fitness, near full-length HIV-1 genomes and intra-patient HIV-1 genetic diversity with viruses from typical and rapid progressor individuals were compared as well as replicative fitness of primary isolates and recombinant fluorescent viruses. HLA typization and the presence of protective alels in some patients have been described, polymorphisms in chemokin receptor was analyzed.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 16, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jan 28, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-MSM-LK-U/01:1
Data delivery date
Jun 22, 2017
Finance
Total approved costs
14,846 thou. CZK
Public financial support
14,846 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK