Czech National Infrastructure for Biological Data
Project goals
Czech National Infrastructure for Biological Data ELIXIR CZ is focused on processing, storage, sharing and analysis of data in life sciences. The aim of the project is to ensure that the data generated by other infrastructures meets the FAIR principles - findable, accessible, interoperable and reusable. These principles are necessary for full utilization the acquire data. The ELIXIR CZ infrastructure is based on the unique know-how of top experts in the fields of bioinformatics, genomics, biology, medicine, informatics and computer engineering. Furthermore ELIXIR CZ provides hardware and software resources and specific architectures according to the nature of processed data. This unique technical solution is primarily fulfilled by e-infrastructures responsible for advanced IT solutions, building data storage, access to data and computing capacities. The aim of the ELIXIR CZ infrastructure is to operate advanced bioinformatics tools, unique and at the same time interoperable data sources for all branches of biology, training of specialists and solutions for dedication of computing resources and their specific technical parameters according to the needs of the user community. The highly developed authorization and authentication tools, which provide access to data sources, are based on their ability to identify users including those relating to highly sensitive data. In general, this solution is a technology applicable to all shared data disciplines across life sciences and essentially beyond. ELIXIR CZ has a strong profile in the area of Data Management, from the level of users to the level of administrators of scientific projects. The concepts and tools in this area are applicable to process solutions from data generation to archiving and usability.
Keywords
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
České vysoké učení technické v Praze / Fakulta informačních technologií
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných vědContest type
VL - Approved by the Government
Contract ID
MSMT-33353/2019-30
Alternative language
Project name in Czech
Česká národní infrastruktura pro biologická data
Annotation in Czech
ELIXIR CZ, česká národní infrastruktura pro biologická data je zaměřena na zpracování, uchovávání, sdílení a analýzu dat v oblasti věd o živé přírodě. Cílem projektu je zajistit, aby data generovaná ostatními infrastrukturami splňovala kritéria FAIR – findable, accessible, interoperable and reusable, nutná k jejich plnému využití. Infrastruktura ELIXIR CZ je založena na expertní části zajišťované unikátním know-how špičkových odborníků z oblasti bioinformatiky, genomiky, biologie, medicíny, informatiky a počítačového inženýrství a na technické části spočívající v heterogenním souboru hardware a software prostředků a specifických architektur podle povahy zpracovávaných dat. Toto unikátní technické řešení je naplňováno především přímým zapojením e-infrastruktur zodpovědných za pokročilá IT řešení, budování datových úložišť, přístup k datům a výpočetním kapacitám. Cílem infrastruktury ELIXIR CZ je provozování pokročilých bioinformatických nástrojů, unikátních a zároveň interoperabilních datových zdrojů pro všechna odvětví současné biologie, školení odborníků a řešení pro dedikaci výpočetních prostředků a jejich specifických technických parametrů podle potřeb uživatelské komunity. Základním prvkem pro přístup a sdílení dat jsou nástroje pro autorizaci a autentizaci uživatelů, které umožňují přístup k datovým zdrojům a nástrojům. Jde většinou o vysoce rozvinuté metody, které jsou na základě schopnosti identifikovat uživatele používány pro přístup k datovým zdrojům včetně těch, které se týkají vysoce citlivých dat. Obecně představuje toto řešení technologii použitelnou ve všech disciplínách pracujících se sdílenými daty napříč vědami o živé přírodě a v podstatě i mimo ni. ELIXIR CZ se výrazně profiluje v oblasti správy dat (Data Management), a to od úrovně uživatelů po úroveň administrátorů vědeckých projektů. Koncepce a nástroje v této oblasti jsou aplikovatelné na řešení procesů od generování dat po jejich archivaci a využitelnost.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The large research infrastructure provided services to the scientific community from the Czech Republic and abroad in accordance with the goals of the project and ensured the participation of the Czech Republic in transnational structures. Both in the performance of its services at home and in its international reach, the project fully fulfilled its mission.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 20, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-LM-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
146,845 thou. CZK
Public financial support
146,845 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
146 845 CZK thou.
Public support
146 845 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
OECD FORD
Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Solution period
01. 01. 2020 - 31. 12. 2022