Czech Centre for Phenogenomics
Project goals
The Czech Centre for Phenogenomics (CCP) is the only specialized workplace in the Czech Republic that creates genetically modified mouse and rat models, at the level of the world's best centres, while using the most advanced standardized phenotyping to characterize the gene functions in vivo. CCP provides a full spectrum of genetic engineering services including the generation of mouse models of disease, cryoarchiving and distribution. A key facility of CCP is the Phenotyping Module performing high throughput but standardized analysis capturing nearly 1000 unique parameters to each (or its mutation) gene analyzed. CCP is a member of the pan-European INFRAFRONTIER consortium, and the IMPC consortium with a global outreach, which aims to create an ‘encyclopedia’ of the function of all mammalian genes (human gene as an aim) to help identify causal factors in human disease and new targets for therapeutic intervention. CCP is developing preclinical testing procedures to support translation of the research into application, including PDX (Patient-Derived Tumor Xenograft) technology studying the development of human tumors as well as customized preclinical research that includes disease model generation and testing potential therapeutics, pharmacokinetics, pharmacodynamics and toxicology. The above constitute the main objectives: 1/generation of precise animal models using genome editing to reveal gene function in the physiology of the organism and during disease development, and development of novel genome manipulation technologies, 2/standardized and comprehensive characterization/phenotyping, and development and establishment of novel phenotyping technologies, 3/ preclinical research to support the development of new treatment options, including the development of new drugs, as well as the testing the treatments for infections in model organisms, and 4/ development and establishment of knowledge and technologies for gene and precision therapy and diagnostics.
Keywords
genegenometransgenic model organismphenotypinggene therapypreclinical researchresearch infrastructure
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VL - Approved by the Government
Contract ID
MSMT-36/2023
Alternative language
Project name in Czech
České centrum pro fenogenomiku
Annotation in Czech
České centrum pro fenogenomiku (CCP) je jediným specializovaným pracovištěm v ČR, které na úrovni nejlepších světových center vytváří geneticky modifikované myší a potkaní modely pro nepostradatelný biomedicínský výzkum a zároveň používá nejpokročilejší standardizovanou fenotypizaci pro charakterizaci projevů funkcí genů. CCP poskytuje plné spektrum služeb genetického inženýrství zahrnující tvorbu myších modelů nemocí, jejich kryoarchivaci a distribuci. Klíčovým pracovištěm CCP je Fenotypizační modul provádějící vysokokapacitní ale standardizovanou analýzu transgenních zvířecích modelů zachycující téměř 1000 unikátních parametrů ke každému analyzovanému genu a vlivu jeho mutace v organismu nebo při vzniku a léčbě nemocí. CCP je členem pan-evropského konsorcia INFRAFRONTIER, a konsorcia IMPC s celosvětovým působením, jehož cílem je vytvořit “encyklopedii“ funkce všech genů savců (cílem je člověk), která by pomohla identifikovat kauzální faktory lidských nemocí i nové cíle pro terapeutické intervence. CCP rozvíjí postupy preklinického testování, aby podpořilo translaci výzkumných výsledků do praxe, včetně technologie PDX (Patient-Derived tumor Xenograft), která studuje vývoj lidských nádorů v myších modelech a možnosti jejich terapie a také preklinický výzkum na míru, který zahrnuje tvorbu modelu onemocnění a všechny testy potenciálních terapeutik včetně farmakokinetiky, farmakodynamiky a toxikologie. Výše uvedené vytváří hlavní cíle: 1/tvorba precizních zvířecích modelů pomocí genomového editování k odhalení funkce genů ve fyziologii organismu i během vývoje nemoci, a vývoj nových technologií genomové manipulace, 2/standardizovaná a komplexní charakterizace/fenotypování, a vývoj a etablování nových technologií fenotypování, 3/ preklinický výzkum a vývoj jako podpora vývoje nových možností léčby včetně vývoje nových léků, a také testování léčby infekcí na modelovém organismu, a 4/vývoj a etablování znalostí a technologií pro genovou a precizní terapii a diagnostiku.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 17, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MSM-LM-R
Data delivery date
Feb 20, 2025
Finance
Total approved costs
315,960 thou. CZK
Public financial support
315,960 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
315 960 CZK thou.
Public support
315 960 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
OECD FORD
Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Solution period
01. 01. 2023 - 31. 12. 2026