A study on pollen competition in Arabidopsis thaliana hybrids
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
SMSM2019LTAIN
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-2066/2020-4
Alternative language
Project name in Czech
Studie pylové kompetice mezi hybridy Arabidopsis thaliana
Annotation in Czech
Hlavním cílem tohoto projektu je popsat reprodukční zdatnost pylu různých ekotypů huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana) a jejich hybridů. Tohoto hlavního cíle bude dosaženo prostřednictvím tří dílčích cílů, jejichž řešení bude rozděleno do tří etap. 1) Pylová kompetice in vivo mezi ekotypy Arabidopsis. Různé kombinace samčích a samičích rodičovských rostlin budou hybridizovány a bude porovnána reprodukční zdatnost jednotlivých ekotypů i jejich F1 hybridů. Tento přístup bude povede ke zhodnocení sporofytických a v pozdějších fázích i gametofytických faktorů ovlivňujících hybridizační potenciál (etapa E001) také ve spojitosti s podmínkami vnějšího prostředí (etapa E002). 2) Vliv hybridizace na přednostní oplození semi-in vivo (SIV). Kombinace ekotypů huseníčku a jejich hybridů vybrané na základě výsledků předchozího cíle budou studovány semi-in vivo, konkrétně selektivní či přednostní navigace pylových láček k různým kombinacím vajíček k jejich následnému oplození. Tento přístup pomůže ozřejmit vliv gametofytických naváděcích signálů mezi různými ekotypy a jejich hybridy (etapa E002). 3) Identifikace genů a proteinů odlišně exprimovaných v jednotlivých ekotypech a jejich hybridech po opylení semi-in vivo. Z pylových láček různých ekotypů a jejich hybridů kultivovaných semi-in vivo za přítomnosti vajíček různých ekotypů budou izolovány RNA a celkové a sekretované proteiny, jež budou použity pro transkriptomické, proteomické a sekretomické analýzy. Vybrané kandidátské geny budou dále funkčně charakterizovány a bude zjišťována jejich důležitost pro reprodukční a hybridizační zdatnost (etapy E002 a E003).
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - another secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
During the project, 8 papers were published in high-quality scientific journals (Annu Rev Plant Biol, Nature Plants, New Phytol, Development, Front Plant Sci, Plants). They relate to factors affecting Arabidopsis hybridization and reproduction. International cooperation within the COST action through sharing of material as well as a direct collaboration, contributed markedly to the results.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 24, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
5,632 thou. CZK
Public financial support
5,632 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK