Adaptive evolution and epidemiology of a parasite in the context of change in host behavior: the bed bug resurgence
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 10 (SMSM2018LTA02)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-39022/2018-1
Alternative language
Project name in Czech
Vznik specifických adaptací a epidemiologie parazita v souvislosti se změnami chování hostitele: návrat štěnice domácí
Annotation in Czech
Štěnice domácí je obligátním haematofágním ektoparazitem, který přechodem ze svého původního hostitele – netopýrů – vytvořil specializovanou linii na člověku. Poté, co byla štěnice ve vyspělých zemích v 50. letech 20. století prakticky vyhubena, se v posledních dvou dekádách vrací. Vedle globalizačních tendencí současné lidské společnosti bylo jako hlavní důvod současné expanze identifikováno několik mechanismů resistence k insekticidům. Projekt si ve spolupráci s pracovištěm v USA klade za cíl zmapovat populační strukturu štěnice na bezprecedentní škále dvou kontinentů. Pomocí metod ddRAD (double digest restriction associated DNA) a sekvenace RNA využívá potenciálu nové generace sekvenátorů. Genomický přístup populačně genetické studie navíc umožňuje identifikovat lokusy pod selekčním tlakem a přímo tak určit adaptivní mechanismy současné expanze. Projekt zároveň hledá příčiny šíření štěnice ve změnách lidského chování. Design vzorkování zahrnuje kompaktní síť měst v několika sousedících státech Evropy a USA. Socio-demografické parametry jednotlivých měst budou testovány na korelaci s genetickou strukturou štěnice. Bude tak určen vliv různých typů migrace obyvatel na disperzi štěnice a sociální situace na význam lokálních refugií. Populační struktura štěnice bude také vztažena k dopravní konektivitě cílových měst. V některých městech bude analyzována dynamika populace na časové škále za využití sedm let starých vzorků. Takto získané znalosti o populační struktuře a dynamice štěnice přiblíží mechanismy vzniku a šíření resistentních kmenů. Pomohou tak zefektivnit praxi kontroly štěnice a navrhnou opatření k prevenci dalšího šíření. Zároveň poslouží jako obecný epidemiologický model šíření patogenů v moderní dynamické lidské společnosti. V obecně evolučním kontextu pak výsledky projektu zdokumentují mechanismy vzniku a fixace adaptivních znaků v populaci parazitického organismu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10613 - Zoology
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>EG - Zoology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
"We synthesized new nucleoside analogs and non-nucleoside inhibitors with antiviral activity against flaviviruses and low toxicity. Some antivirals exerted an antiviral effect on experimental animals. The molecular mechanisms of viral resistance to nucleoside antivirals have been elucidated. A total of 9 papers were published, 3 of them with a foreign partner, 2 others are in the review process."
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
7,568 thou. CZK
Public financial support
7,568 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK