All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Utilization of integrative molecular biophysical approaches for the functional studies of human natural killer cell receptors and formation of their complexes with tumour ligands

Public support

  • Provider

    Ministry of Education, Youth and Sports

  • Programme

    INTER-EXCELLENCE

  • Call for proposals

    INTER-EXCELLENCE 2 (SMSM2016LTC01)

  • Main participants

    Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    MSMT-15304/2017-1

Alternative language

  • Project name in Czech

    Využití kombinace molekulárních biofyzikálních přístupů pro funkční studie lidských receptorů NK buněk a tvorby jejich komplexů s nádorovými ligandy

  • Annotation in Czech

    Předkládaný projekt si klade za cíl objasnit chování dvou vybraných interakčních párů receptor – ligand, a to konkrétně NK buněčných receptorů NKR-P1 a NKp30 a jejich interakce s jejich terapeuticky relevantními ligandy LLT1, resp. B7-H6. V případě interakce NKR-P1 – LLT1 představuje výzvu skutečnost, že afinita interakce jednotlivých rozpustných vazebných domén těchto proteinů je velmi slabá a v roztoku pomocí běžných metod obtížně pozorovatelná. Přesto se však týmu řešitele projektu podařilo vyřešit krystalovou strukturu komplexu NKR-P1 – LLT1 (manuskript v přípravě), což lze vzhledem k předkládanému projektu považovat za klíčový předběžný výsledek (blíže viz bod 4). Z analýzy této struktury vychází hypotéza, že nízká afinita vazby je na buněčném povrchu kompenzována oligomerizací receptoru indukovanou vazbou ligandu. Cílem této části projektu je tedy jednak pozorovat tento proces na živých buňkách s pomocí fluorescenčně značených proteinů a technik fluorescenční mikroskopie, jednak tato pozorování korelovat s měřením vazby v roztoku, tzn. optimalizovat metodické uspořádání interakčních experimentů pro detekci i slabé vazby/oligomerizace.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    BO - Biophysics

  • CEP - secondary branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - another secondary branch

    EC - Immunology

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30102 - Immunology

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    In 2019 research from the 2nd and 3rd project phase was performed according to the plan, including 2 working visits to Technical University Vienna (Dr. Mario Brameshuber; characterization of NKR-P1:LLT1 interaction and NKp30 homo-oligomerization on the cell surface and supported lipid bilayers), analysis of LLT1 binding mutant, 1 publication was published, 2 are under review, 1 in preparation.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    May 17, 2017

  • Realization period - end

    Apr 5, 2020

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Feb 24, 2020

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP21-MSM-LT-U/01:1

  • Data delivery date

    Jun 15, 2021

Finance

  • Total approved costs

    3,751 thou. CZK

  • Public financial support

    3,751 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK