Utilization of integrative molecular biophysical approaches for the functional studies of human natural killer cell receptors and formation of their complexes with tumour ligands
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 2 (SMSM2016LTC01)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-15304/2017-1
Alternative language
Project name in Czech
Využití kombinace molekulárních biofyzikálních přístupů pro funkční studie lidských receptorů NK buněk a tvorby jejich komplexů s nádorovými ligandy
Annotation in Czech
Předkládaný projekt si klade za cíl objasnit chování dvou vybraných interakčních párů receptor – ligand, a to konkrétně NK buněčných receptorů NKR-P1 a NKp30 a jejich interakce s jejich terapeuticky relevantními ligandy LLT1, resp. B7-H6. V případě interakce NKR-P1 – LLT1 představuje výzvu skutečnost, že afinita interakce jednotlivých rozpustných vazebných domén těchto proteinů je velmi slabá a v roztoku pomocí běžných metod obtížně pozorovatelná. Přesto se však týmu řešitele projektu podařilo vyřešit krystalovou strukturu komplexu NKR-P1 – LLT1 (manuskript v přípravě), což lze vzhledem k předkládanému projektu považovat za klíčový předběžný výsledek (blíže viz bod 4). Z analýzy této struktury vychází hypotéza, že nízká afinita vazby je na buněčném povrchu kompenzována oligomerizací receptoru indukovanou vazbou ligandu. Cílem této části projektu je tedy jednak pozorovat tento proces na živých buňkách s pomocí fluorescenčně značených proteinů a technik fluorescenční mikroskopie, jednak tato pozorování korelovat s měřením vazby v roztoku, tzn. optimalizovat metodické uspořádání interakčních experimentů pro detekci i slabé vazby/oligomerizace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EC - Immunology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30102 - Immunology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
In 2019 research from the 2nd and 3rd project phase was performed according to the plan, including 2 working visits to Technical University Vienna (Dr. Mario Brameshuber; characterization of NKR-P1:LLT1 interaction and NKp30 homo-oligomerization on the cell surface and supported lipid bilayers), analysis of LLT1 binding mutant, 1 publication was published, 2 are under review, 1 in preparation.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 17, 2017
Realization period - end
Apr 5, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 24, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-MSM-LT-U/01:1
Data delivery date
Jun 15, 2021
Finance
Total approved costs
3,751 thou. CZK
Public financial support
3,751 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK