Study of domain interactions of intrinsically disordered protein MAP2c (Microtubule-Associated Protein 2c) with its binding partners via computational methods and nuclear magnetic resonance
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 2 (SMSM2016LTC01)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-15304/2017-1
Alternative language
Project name in Czech
Studium interakcí domén přirozeně neuspořádaného proteinu MAP2c (microtubule- associated protein 2c) s jeho vazebnými partnery pomocí výpočetních metod a nukleární magnetické rezonance
Annotation in Czech
Cílem projektu je experimentálně popsat dosud nedostatečně prozkoumané vlastnosti domén, a vliv jednotlivých regionů MAP2c na funkci celého proteinu či na interakci s případnými vazebnými partnery, čehož chceme dosáhnout kombinací výpočetních a experimentálních metod. Jelikož cílovou molekulou je přirozeně neuspořádané protein strukturně i funkčně spojovaný s rozvojem neurodegenerativních chorob, je projekt atraktivní i z hlediska lékařského využití a výsledná publikace může posloužit pro další specifičtější výzkum.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Based on analysis of NMR parameters, we characterized transient structures of protein Tau and compared them with the results of the MAP2c analysis. We revealed large differences in N-terminal regions and important deviations in C-terminal parts. We compared results for both proteins with their interactions, physiological, and pathological functions, and published them in the journal Biomolecules
Solution timeline
Realization period - beginning
Jun 1, 2017
Realization period - end
Mar 25, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 25, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-MSM-LT-U/01:3
Data delivery date
Jun 19, 2020
Finance
Total approved costs
1,425 thou. CZK
Public financial support
1,425 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK