Characterization of nuclear proteomes in the male germline and their implications under standard and stress conditions
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 13 (SMSM2018LTC01)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-16506/2018-18
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace jaderného proteomu samčí zárodečné linie a jeho dynamika za standardních podmínek a po působení stresu
Annotation in Czech
Vývoj pylu, zejména jeho časná fáze vedoucí k diferenciaci generativní buňky (buněk), je z hlediska uspořádání a mikrostruktury jádra obzvláště zajímavým tématem základního výzkumu. Kondenzace chromatinu ve spermatických buňkách ve spojení s dekondenzací chromatinu pozorovanou v pylovém vegetativním jádře jsou životně důležité procesy pro vývoj pylu a interference v těchto rozhodujících procesech vede ke vzniku neživotaschopného pylového ve svém důsledku i k závažnému snížení tvorby semen a tím i k poklesu výnosu zemědělských plodin. Procesy (de)kondenzace chromatinu a epigenetické přeprogramování (angl. reprogramming) jsou také ovlivněny stresy okolního prostředí, jež významným způsobem ovlivňují methylační stav DNA. Analýza proteomu jaderných a spermatických buněk v těchto časných vývojových stádiích pylu prováděná za standardních podmínek a v režimu tepelného stresu, nám pomůže rozpoznat důležité faktory, které se tohoto procesu účastní, a umožní identifikaci nových. Shromážděné informace budou předány do sdíleny se členy konsorcia a nové faktory interagující s jádrem mohou být dále integrovány v rámci vznikající platformy pro 3-D zobrazování jader, která bude vytvořena v rámci akce COST CA16212. Předpokládáme také provedení stejných analýz v rostoucích pylových láčkách. Aplikace tepelného stresu na dehydratovaný pyl následovaná proteomickou analýzou objevivších se pylových láček, povede k identifikaci faktorů, které se podílejí na vnímání tepelného stresu příslušnou odezvu v tomto efektivně jednobuněčném systému během funkční, progamické fáze.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aim of the project was the proteomic identification of nuclear-encoded proteins that are affected by heat stress during pollen development. The study created and utilised RNAi lines downregulated in the HSP90 gene expression specifically during pollen development. Gene families involved in translation and nuclear localisation machinery were the most prominent in the HSP90 downregulated lines.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jun 1, 2018
Realization period - end
Nov 27, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 9, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
4,544 thou. CZK
Public financial support
4,544 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK