High-throughput screening for new anthelmintics
Project goals
Parasitic helminths infect about one-quarter of the world population. Parasites of livestock and crops cause significant economic loss. Most of the human and veterinary medicines belong to only a few classes from the point of view of the chemical structure. A resistance to each of them has been reported The goal of the project is the identification of novel structural classes of anthelmintics by the means of high-throughput screening on model nematode C. elegans . C. elegans is sensitive to most of the established anthelmintics and has been used for the studies of the resistance mechanisms. The hits will be tested on parasitic helminths (Teladorsagia circumcinata, Trichostrongylus spp., Strongyloides venezuelenzis). The effect of the compounds will be evaluated by automated microscopy and image analysis. A software employing methods of machine learning able to detect relevant phenotypes (death, paralysis, reproductive toxicity) will be developed for this purpose. We will take initial steps to identify the action mechanism of selected compounds (mutagenesis in C. elegans, sequencing of the resistant strains). We will establish an online database integrating chemical and biological information about compounds active against parasitic nematodes.
Keywords
Ceanorhabditis elegansnematodesparasitismanthelminticshigh-throughput screeningimage analysischeminformatics
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 22 (SMSM2019LTC01)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-15739/2019-15
Alternative language
Project name in Czech
Vysokokapacitní vyhledávání nových anthelmintik
Annotation in Czech
Parazitičtí hlísti infikují významnou část světové populace. Infekce hospodářsky významných živočichů a rostlin je příčinou významných ekonomických ztrát. Z hlediska chemické struktury patří používaná humánní a veterinární léčiva k několika málo typům, přičemž výskyt resistence byl pozorován pro všechny z nich. Cílem projektu je identifikace nových strukturních typů anthelmintik pomocí vysokoformátového skríningu na modelové hlístici C. elegans, která je citlivá k většině používaných anthelmintik a používá se ke studiu resistence k nim. Aktivní látky budou dále testovány na parazitických hlístících (Teladorsagia circumcincta, Trichostrongylus spp., Strongyloides venezuelensis). Vliv látek bude hodnocen především pomocí automatické mikroskopie a analýzy obrazu. Vyvineme software pro analýzu mikroskopických snímků využívající metod strojového učení, který umožní detekovat spektrum fenotypů relevantních pro hodnocení aktivity testovaných látek (smrt, paralytické stavy, reprodukční toxicita). Pro vybrané látky se pokusíme identifikovat molekulární cíl (sekvenace rezistentních mutantů C. elegans). Vytvoříme také online databázi látek aktivních proti parazitickým hlístům integrující relevantní informace jak biologické (např. molekulární cíl, jeho homologie mezi parazity), tak chemické (např. vyhledávání podobných látek).
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Automated microscopy-based screening of chemical library for anthelmintic activity on model nematode C. elegans and veterinary paraisite Haemonchus contortus led to identification of actives of several structural types. They were active also against strains resistant to current anthelmintics. A software for image analysis and database of nematocides were developed.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jun 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 15, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data delivery code
CEP22-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
2,543 thou. CZK
Public financial support
2,543 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 543 CZK thou.
Public support
2 543 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
OECD FORD
Microbiology
Solution period
01. 06. 2019 - 31. 12. 2021