Galectins as biomarkers of colorectal cancer
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 22 (SMSM2019LTC01)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
LTC19035
Alternative language
Project name in Czech
Galektiny jako biomarkery kolorektální rakoviny
Annotation in Czech
Cílem projektu je vývoj syntézy komplexních oligosacharidových ligandů čistě pomocí mikrobiálních glyko-sidas s širokou substrátovou specifitou pro design nového typu biosenzoru založeného na vysoce selektivní a specifické interakci galektinů a připravených oligosacharidů. Navržený pilotní biosenzor bude sloužit k detekci hladiny vybraných galektinů (Gal-1, -3 a -4) při neinvazivním screeningu kolorektální rakoviny z krevního séra testovaných osob. Pomocí chemoenzymové syntézy bude připraveno několik typů funkcionalizovaných oligosa-charidových ligandů (di- až tetrasacharidy) s vysokou afinitou a selektivitou vůči jednotlivým galektinům; syntéza optimalizovaných struktur bude převedena do semipreparativního měřítka potřebného pro vývoj účinného biosenzoru. V rámci projektu budou heterologně exprimovány mikrobiální glykosidasy (β-galaktosidasa a přiro-zené i mutantní β-N-acetylhexosaminidasy) vhodné pro enzymovou syntézu požadovaných oligosacharidových struktur a galektin-4, který potřebujeme jako standard pro vývoj vazebných testů a biosenzoru. Afinita a selekti-vita připravených látek bude stanovována pomocí imunochemických metod (ELISA), a to jak metodou přímou tak kompetitivní. Optimalizované struktury budou dále použity k vývoji metody ELISA pro stanovení jednotlivých galektinů v krevním séru. V poslední fázi projektu budou připraveny a testovány pilotní senzory, kde budou námi připravené oligosacharidy navázané na biosenzory na bázi SPR čipů pro sledování vazby mezi ligandem a galekti-nem přítomným v krevním séru.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
30204 - Oncology
OECD FORD - another secondary branch
30205 - Hematology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology<br>FD - Oncology and haematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Fungal β-N-acetylhexosaminidase was mutated in order to increase its selectivity. Tetrasaccharide ligands of galectin-4 were prepared using wild-type and mutant glycosidases. Galectin-4 and its separate binding domains were expressed in E. coli and purified to homogeneity. The prepared tetrasaccharides and other oligosaccharides were tested as ligands of Gal-4 by the ELISA method
Solution timeline
Realization period - beginning
Jun 1, 2019
Realization period - end
Sep 29, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 24, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
4,421 thou. CZK
Public financial support
4,421 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK