Unveiling the impact of human activities on the distribution of parasites in aquatic ecosystems using metagenomic analysis

Provider

Ministry of Education, Youth and Sports

Programme

—

Call for proposals

SMSM2023LU001

Main participants

Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

MSMT – MSMT-1445/2024-29

Project name in Czech

Odhalování vlivu lidské činnosti na rozšíření parazitů ve vodních ekosystémech pomocí metagenomické analýzy

Annotation in Czech

Hlavním cílem navrženého projektu je podpořit a posílit již existující spolupráci mezi týmem doc. Atkinsona na Oddělení mikrobiologie, Oregonské státní univerzity v USA a naší Laboratoří rybí protistologie na Parazitologickém ústavu Biologického Centra AV ČR. V rámci naší spolupráce budeme provádět monitoring rozšíření rybích patogenů a zjišťování diverzity rybích parazitů v souvislosti s lidskou činností. Konkrétně budeme sledovat rozšíření rybomorek (myxozoí) a mikrosporidií ve vodních habitatech ovlivněných stavbou přehrad nebo intenzitou rybnikářství. Zaměříme se nejen na monitoring ekonomicky významných druhů patogenů ze skupiny Myxozoa (rybomorky) jako jsou Ceratonova shasta, Parvicapsula minibicornis a Sphaerospora molnari, a ze skupiny Microsporidia (mikrosporidie, hmyzomorky) jako jsou Loma salmonae a Nucleospora salmonis, ale také na sledování druhového spektra a jeho změn u dalších druhů rybích parazitů z daných dvou skupin objevujících se ve sledovaných habitatech. Na základě monitoringu budeme schopni posoudit změny parazitofauny rybomorek a mikrosporidií vlivem lidské činnosti: i) před a po odstranění přehrad na příkladě postupného odstranění přehrad na severoamerické řece Klamath a obnově původního ekosystému, především populací lososů a jejich návratu do původních míst jejich rozšíření a třecích oblastí (trdlišť), ii) na řece (horní tok Lužnice) s přírodním nenarušeným rázem a s vodním tokem (Zlatá stoka) spojeným s rozsáhlou sítí rybníků na Třeboňsku, iii) na třech Českých řekách s přítomností významné přehrady (Římov- ř. Malše,Žlutice – ř. Střela, Klíčava – ř. Klíčava). Na základě našeho výzkumu se budeme na konci projektu snažit najít společné prvky v charakteru změn diverzity rybomorek a mikrosporidií ve středoevropských lokalitách a v povodí řeky Klamath na severozápadě Spojených států vlivem lidské činnosti.

R&D category

ZV - Basic research

OECD FORD - main branch

10618 - Ecology

OECD FORD - secondary branch

—

OECD FORD - another secondary branch

—

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

EH - Ecology - communities

Realization period - beginning

Mar 1, 2024

Realization period - end

Dec 31, 2027

Project status

Z - Beginning multi-year project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP24-MSM-LU-R

Data delivery date

Feb 8, 2024

Total approved costs

9,997 thou. CZK

Public financial support

9,997 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK