The role of DNA/RNA-binding proteins in cellular processes of S. pneumoniae

Provider

Ministry of Education, Youth and Sports

Programme

—

Call for proposals

SMSM2025LU001

Main participants

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

MSMT-335/2025-13

Project name in Czech

Role DNA/RNA vazebných proteinů v buněčných procesech S. pneumoniae

Annotation in Czech

Cíl 1: Analýza funkce proteinu buněčného dělení KhpB (i) zjistit, zda je KhpB synteticky letální s DivIVA. (ii) Určit, zda fosforylační stav KhpB ovlivňuje syntetickou letalitu a morfologii buněk. (iii) Určit interaktom KhpB. (i) Následující skutečnosti a naše experimentální výsledky nás vedly k návrhu prozkoumat interakci mezi proteiny buněčnéhodělení KhpB a DivIVA. Esenciální protein GpsB je považován za paralog DivIVA u Firmicutes díky společné sekvenční podobnosti vN-terminálním sekvenčním motivu a superponované terciární struktuře. Deplece DivIVA nebo GpsB mají opačný fenotyp a vedouke zkracování, respektive prodlužování buněk [22]. Je známo, že delece khpB potlačuje letální fenotyp delece gpsB [19]. Podlevýsledků našich fosforylačních experimentů jsme zjistili, že DivIVA inhibuje fosforylační reakci, na rozdíl od GpsB, který fosforylačníreakci stimuluje (Stauberová a kol., manuskript J.Mol.Biol. v revizi). Předpokládáme, že kompetice DivIVA o interakci s StkP spolu sKhpB by mohlo ovlivnit. syntézu PG a vést k preferenci elongace nebo septace. Z dvouhybridních experimentů a co-IP experimentůnavíc víme, že KhpB interaguje jak s GpsB, tak s DivIVA (Malcolm Winkler - osobní sdělení), stejně jako GpsB interaguje přímo sDivIVA. Na základě těchto zjištění jsme formulovali hypotézu, že tyto proteiny mají opačné antagonistické účinky a že současnádelece khpB a divIVA by mohla mít letální účinek, zatímco delece KhpB potlačuje esencialitu GpsB. Ke zjištění, zda je KhpBsynteticky letální s DivIVA, lze provést test syntetické letality.V tomto případě by kmeny exprimující z nativního promotoru WT a zkrácené deriváty khpB genu s odstraněnými specifickýmidoménami byly transformovány pomocí DNA fragmentu určeného k deleci divIVA genu. Následně by se spočítala a porovnalaúčinnost transformace.

R&D category

ZV - Basic research

OECD FORD - main branch

10606 - Microbiology

OECD FORD - secondary branch

10601 - Cell biology

OECD FORD - another secondary branch

—

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

EA - Morphology and cytology<br>EE - Microbiology, virology

Realization period - beginning

Mar 1, 2025

Realization period - end

Dec 31, 2028

Project status

Z - Beginning multi-year project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP25-MSM-LU-R

Data delivery date

Feb 5, 2025

Total approved costs

7,718 thou. CZK

Public financial support

7,718 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK