Study of the interactions between forkhead transcription factor AFX and DNA.
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Support of incipient R&D workers
Call for proposals
Program podpory začínajících pracovníků výzkumu a vývoje (LZ) (SMSM200300001)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium interakcí forkhead transkripčního faktoru AFX s DNA
Annotation in Czech
AFX patří do FOXO podrodiny Forkhead transkripčních faktorů, které hrají důležitou roli při kontrole metabolismu, embryogenezi, apoptóze, nebo onkogenezi. Aktivita těchto transkripčních faktorů je regulována fosforylací protein kinázou Ba interakcí se 14-3-3 proteiny. FOXO transkripční faktory specificky váží DNA sekvenci T(G/A)TTTTG, která je známá jako ?insulin response element (IRE). V současné době je k dispozici málo strukturních dat popisujících interakce mezi FOXODNA-vazebnou doménou a DNA. To znemožňuje provést strukturní analýzu interakcí FOXO DNA-vazebných domén s DNA a definovat strukturní prvky, které jsou jednoznačně zodpovědné za vazebnou specifitu těchto domén. Tento projekt proto navrhuje provésttuto strukturní analýzu pomocí proteinovékrystalografie a fluorescenční spektroskopie. To umožní lépe pochopit mechanismus regulující DNA vazebnou specifitu a vůbec mechanismus celkové regulace těchto biologicky důležitých transkripčních faktorů.
Scientific branches
R&D category
IF - RDI infrastructure
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - another secondary branch
BO - Biophysics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Binding properties of DNA binding domain of transcription factor AFX are modulated through conformational changes of the binding site as a consequence of the 14-3-3 protein binding. 14-3-3 changes structure of various parts of DNA binding domain of AFX.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-MSM-LZ-U/04:2
Data delivery date
May 29, 2008
Finance
Total approved costs
1,321 thou. CZK
Public financial support
1,152 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
169 thou. CZK