The structure and expression of ribosomal RNA genes in invasive Spartina anglica allopolyploid species that formed recently in Europe
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT
Call for proposals
—
Main participants
—
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
5727/2011-320
Alternative language
Project name in Czech
Struktura a exprese genů pro ribosomálních RNA v přirozených populacích alopolyploidní Spartina anglica jako významného evropského rostlinného invazivního druhu.
Annotation in Czech
Cílem projektu je studium struktury a exprese genů pro ribozomální RNA v přirozených populacích invazivního travního druhu Spartina anglica. 1. Genetické aspekty studia. V této části se budeme věnovat otázkám genetických interakcí, rekombinací a homogenizací rodičovských genů rRNA. Bude uskutečněna genetická analýza populací pocházejících z různých lokalit francouzského a britského pobřeží (viz. obr. 1). Budeme řešit otázku, zda genetické změny v lokus rDNA (pokud budou zaznamenány) jsou vyvolané mezidruhovou hybridizací nebo následnou polyploidií. Experimentální systém sterilního hybridu S. townsendii a z něj derivované S. anglica, jako jediný na světě, umožňuje poskytnout odpověď na tuto otázku. 2. Epigenetické aspekty. V této části se budeme zabývatproblematikou epigenetického umlčování exprese rodičovských genů rRNA v různých populacích S. anglica a S. townsendii. Budeme řešit otázky, zda fenomén nukleolární dominance (též transkripční umlčování genové exprese) je zákonitý nebo stochastický, zdaje ovlivňován populační dynamikou, duplikací chromosomových sad eventuelně genovými přestavbami v průběhu polyploidie a zda existuje korelace mezi umlčováním a metylací DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EH - Ecology - communities
CEP - another secondary branch
BO - Biophysics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project is being realized in the framework of the MOBILITY Activity that aims primarily on establishing and strenghtening ties with foreign research institutions. The control of particular outputs is not implemented by the evalution committee, but the correctness of allocated finances and the adequacy of their use are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 15, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-MSM-ME-U/01:1
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
128 thou. CZK
Public financial support
128 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK