The impact of genomic shock associated with interspecific hybridization and polyploidization on evolution of rDNA loci in young invasive weeds.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
206-09-1751
Alternative language
Project name in Czech
Vliv genomického šoku spojeného s mezidruhovou hybridizací a allopolyploidizací na evoluci rDNA lokusů u mladých invazivních plevelů
Annotation in Czech
Budeme se zabývat genetickými a epigenetickými změnami rodičovských rDNA provázejících mezidruhovou hybridizaci, následnou polyploidizaci a vznik nových druhů. Naše experimenty by měly přispět k zodpovězení následujících otázek: (i) Jsou změny rodičovských rDNA u umělých allotetraploidů podobné jako u přirozených? (ii) Liší se methylace DNA, modifikace histonů a struktura chromatinu dominantních a umlčených lokusů rDNA? (iii) Je jadérková dominance ovlivněna počtem kopií rodičovských jednotek rDNA, strukturou IGS, genetickým pozadím a vývojovým stadiem rostliny? (iv) Uplatňuje se methylace lysinu 9 histonu H3 a struktura IGS při dlouhodobé stabilitě rodičovských rDNA lokusů v rostlinných hybridech? (v) Probíhá u hybridů homogenizace a specifické umlčení rodičovských 5S rDNA? Pro zodpovězení těchto otázek bude studována heterogenní exprese rRNA genů u přirozených, nedávno opakovaně vzniklých, populací invazních allotetraploidních plevelů rodu Tragopogon a rovněž u geneticky odpovídajících synthetickýchhybridů a allotetraploidů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EH - Ecology - communities
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project succesfully analyzed the evolution of rDNA repeats in allotetetraploids of different age and genera. The comparison of natural and synthetic tetraploids showed that rDNA genotypes and phenotypes seen in old allopolyploids are already presentin the early generations of synthetics. The rDNA evolution is influenced by amplification of orphaned rDNA units at new chromosomal locations.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 6, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
3,819 thou. CZK
Public financial support
3,819 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK