Segmentation, visualization and measurement of fibrous structures in 3D
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT
Call for proposals
—
Main participants
—
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
1484/2009-32
Alternative language
Project name in Czech
Rozpoznávání, vizualizace a měření vláknitých struktur v 3D prostoru
Annotation in Czech
Vývoj metod pro segmentaci vláknitých struktur z trojrozměrných (3D) obrazových dat. Zejména vývoj algoritmů využívající model aktivní kontury a teorii grafů (tzv. "live wire" a "graph cut"), které se budou implementovat ve spojení s objemovými rekontrukcemi a s virtuální realitou. Metody budou aplikovány při segmentaci kapilár snímaných konfokálním mikroskopem. Po úspěšné segmentaci kapilár se vytvoří jejich trojrozměrná počítačová rekonstrukce a budou se měřit biologicky významné geometrické charakteristiky, jako je délka či délková hustota kapilár.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
JC - Computer hardware and software
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>20206 - Computer hardware and architecture
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
We development algorithms for segmentation of fibrous structures, verified them on real microscopic data, and exploited them for 3D reconstructions as well as for measurement of geometrical charakteristics of fibres, namely capillary length.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 9, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-MSM-ME-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2010
Finance
Total approved costs
83 thou. CZK
Public financial support
83 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK