Estimation of occurence of brain metastasis based on gene and protein expression profile in primary non small cell lung cancer
Project goals
Dissemination to the brain is a devastating complication affecting 25% patients with non small cell lung cancer (NSCLC). Prophylactic therapy to the central nervous system is effective in reducing the occurrence of brain metastasis in leukemias and smallcell lung cancer. We hypothesized that the expression of certain genes in primary NSCLC tumors could predict brain metastasis. The expression of candidate genes will be measured by real-time quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction (RQ-PCR) and in given cases by cDNA microarray in 142 frozen NSCLC samples. Univariate and multivariate Cox regression analysis will be used to analyze the correlation between gene expression and the occurrence of brain metastasis. Immunohisotchemistry using tissue microarrays on independent samples will verify the findings. The expression levels of certain genes and proteins in primary NSCLC is expected to identify patients at high risk for brain metastasis, who may benefit from profylactic therapy.
Keywords
Non small cell lung cancergene expressionbrain metastasisimmunohistochemistrycDNA microarraypredictive factorsanalysis
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Departmental Programme of Research and Development - MH II from 2008 to 2011
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví II 2 (SMZ0200901)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NS10259-3/2009
Alternative language
Project name in Czech
Stanovení pravdepodobnosti výskytu mozkových metastáz na základě genového a proteinového expresního profilu u pimárních nemalobuněčních karcinomů plic
Annotation in Czech
Diseminace NSCLC do mozku představuje devastující komplikaci u 25% pacientů. Profylaktická therapie centrálního nervového systému snižuje výskyt mozkových metastáz u leukemií a malobuněčných plicních karcinomů. Lze předpokládat, že změna exprese určitýchgenů a proteinů v primárních NSCLC přispěje k predikci mozkových metastáz. Exprese těchto genů bude měřená pomocí kvantitativní reverzibilní polymerázové řetězové reakce (RQ-PCR) a v určitých připadech pomocí cDNA mikroerejí ve 142 zmražených vzorcích NSCLC. Pro analýzu korelace mezi expresí daných genů a výskytem mozkových metastáz bude použitá univariantní a multivariantní Coxova regresní analýza. Uvedené výsledky budou zárověň ověřovány imunohistochemicky za použití tkáńových mikroerejí. Lze očekávat že změny v expresi některých genů a proteinů v primárních nemalobuněčných karcinomech plic, pomohou identifikovat pacienty s vysokým rizikem mozkových metastáz, kteří mohou profitovat z profylaktické terapie.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The results of the project are new procedures that are applicable in clinical practice to stratify patients into prognostic groups.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Aug 8, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-MZ0-NS-U/09:3
Data delivery date
Oct 31, 2013
Finance
Total approved costs
2,177 thou. CZK
Public financial support
1,998 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
179 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 177 CZK thou.
Public support
1 998 CZK thou.
91%
Provider
Ministry of Health
CEP
FD - Oncology and haematology
Solution period
01. 01. 2009 - 31. 12. 2011