Identification of novel molecular pathways involved in the process of B-cell allelic exclusion; chronic lymphocytic leukemia as the model system
Project goals
Allelic exclusion is a unique phenomenon, ensuring antibody monospecificity of B-lymphocytes. The process is strictly controlled and aberrant B-lymphocytes, expressing two IgVH alleles, are eliminated. Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is a clonal disorder of B-lymphocytes. In 5-8% of cases, expression of two productive IgVH rearrangements have been observed, a process referred to as allelic inclusion. CLL exhibiting allelic inclusion represents a unique model to study the process of allelic exclusion.By microarray RNA expression profiling of clonal CLL cells with allelic exclusion, allelic inclusion and peripheral B-lymphocytes from healthy donors it is possible to identify genes that might play a role in the process of allelic exclusion. By employing gene modulating techniques and tissue cultures it is possible to test the biological effects of candidate genes as identified by RNA microarrays in vitro and delineate signaling pathways involved in the process of allelic exclusion of B- lymphocytes.
Keywords
CLLallelic exclusionallelic inclusionRNA microarrayssignaling pathways
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Departmental Programme of Research and Development - MH II from 2008 to 2011
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví II 1 (SMZ0200801)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NS9652-4/2008
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace nových molekulárních signálních drah v procesu alelické exkluze; chronická lymfocytární leukémie jako modelový sytém
Annotation in Czech
Alelická exkluze je unikátním fenoménem, který zajišťuje protilátkovou monospecifitu B-lymfocytů. Alelická exkluze je velmi přísně kontrolována a aberantní B-lymfocyty jsou v naprosté většině případů eliminovány. Chronická lymfocytární leukémie (CLL) jeklonální onemocnění B-lymfocytů. U 5-8 % případů byl pozorován unikátní jev alelické inkluze, neboli přítomnosti dvou produktivních IgVH přestaveb v jedné buňce. CLL s fenoménem alelické inkluze představuje unikátní model ke studiu procesu alelické exkluze. Srovnáním RNA expresních profilů klonálních CLL buněk s alelickou exkluzí, alelickou inkluzí a zdravých B lymfocytů je možné identifikovat diferenciálně exprimované geny, kterých produkty mohou hrát roli v procesu alelické exkluze. Pomocí technik genového inženýrství lze in vitro otestovat funkci kandidátních genů identifikovaných pomocí RNA microarrays a pokusit se osvětlit molekulární signální dráhy, důležité pro unikátní proces alelické exkluze B-lymfocytů.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Project results evaluation
The authors did not elucidate the moplecular mechanism of allelic exclusion in chronic lymphocytic leukemia.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Aug 8, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-MZ0-NS-U/09:3
Data delivery date
Oct 31, 2013
Finance
Total approved costs
8,112 thou. CZK
Public financial support
8,082 thou. CZK
Other public sources
30 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
8 112 CZK thou.
Public support
8 082 CZK thou.
0%
Provider
Ministry of Health
CEP
FD - Oncology and haematology
Solution period
01. 07. 2008 - 31. 12. 2011