Clonal expansions in chronic lymphocytic leukemia – (epi)genomic characterization towards better disease understanding
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202400001
Main participants
Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NW24-03-00052
Alternative language
Project name in Czech
Klonální expanze u chronické lymfocytární leukémie – (epi)genomická charakterizace pro lepší pochopení nemoci
Annotation in Czech
V předloženém projektu chceme studovat rozvoj chronické lymfocytární leukémie (CLL) prostřednictvím systematické analýzy její víceklonální formy. CLL je obvykle monoklonální onemocnění. V naší předchozí práci jsme však popsali případy víceklonální CLL, kde u jednoho pacienta dochází k expanzi více klonů B lymfocytů s nepříbuznými imunoglobulinovými receptory. Takové případy lze považovat za mezistupeň mezi premaligní fází a rozvinutou CLL a představují unikátní model pro výzkum vývoje CLL. Naše dosavadní výsledky ukazují, že koexistující CLL klony významně častěji nesou shodný mutační status imunoglobulinového variabilního genu IGHV, který může odrážet maturační stádium vývoje B lymfocytu, kdy došlo k maligní transformaci. Pomocí sekvenování transkriptomu a analýzy přístupnosti chromatinu v jednotlivých buňkách stanovíme molekulární profily odrážející tato stádia. Určíme, zda jsou společná či odlišná pro koexistující klony. Dále literatura dokládá, že k abnormalitám iniciujícím CLL může dojít již na úrovni hematopoetického progenitoru. Využijeme proto celoexomové sekvenování, abychom identifikovali mutace sdílené koexistujícími klony, které potenciálně ovlivňují jejich proliferaci v iniciálních stádiích vývoje, a stanovíme jejich funkční dopady. Detekované somatické varianty navíc využijeme pro sestavení klonální architektury a fylogenetických stromů popisujících vývoj jednotlivých klonů.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30204 - Oncology
OECD FORD - secondary branch
30205 - Hematology
OECD FORD - another secondary branch
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EI - Biotechnology and bionics<br>FD - Oncology and haematology
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NW-R
Data delivery date
Mar 25, 2024
Finance
Total approved costs
15,461 thou. CZK
Public financial support
15,461 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK