Contributing potential of MALDI-TOF spectrometry and HRMA in identification and typing of bacterial pathogens – evaluation on the model of COPD, bronchiectasis and cystic fibrosis
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Ministry of Health?s Departmental Research and Development Programme III
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 3 (SMZ0201201)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NT13560-4/2012
Alternative language
Project name in Czech
Potenciál přínosu PCR-HRMA a MALDI-TOF spektrometrie v identifikaci a typizaci bakteriálních patogenů – posouzení na modelu CHOPN, bronchiektázií a cystické fibrózy
Annotation in Czech
Předmětem projektu je průkazná prospektivní studie výkonnosti MALDI-TOF spektrometrie a analýzy tání produktů PCR-amplifikace s vysokým rozlišením (PCR-HRMA) resp. analýzy tání produktů RAPD (McRAPD) v identifikaci resp. typizaci patogenů ve srovnání s referenčními technikami (16S rDNA sekvenování, resp. MLST). Pro druhovou identifikaci bude otestován komerční MALDI-TOF přístup a již zavedený PCR-HRMA přístup. Pro typizaci bude otestován MALDI-TOF přístup a McRAPD přístup u kmenů Haemophilus influenzae. Testování bude prováděno na izolátech ze sputa pacientů trpících chronickou obstrukční plicní nemocí (CHOPN), bronchiektáziemi (BE) a cystickou fibrózou (CF). Pro identifikační techniky bude vypočtena přesnost a reprodukovatelnost a pro typizační techniky rozlišovací schopnost. Na základě klinických dat bude odhadnut potenciál skutečného přínosu testovaných technik pro klinickou péči o pacienty.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project assessed the usefulness of PCR with high resolution melting analysis in speciation of selected respiratory pathogens, and in genotyping of Haemophilus influenzae by Random Amplified Polymorphic DNA.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 20, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MZ0-NT-U/02:1
Data delivery date
Dec 19, 2016
Finance
Total approved costs
3,539 thou. CZK
Public financial support
3,539 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK