Pathogenic yeast species identification based on analysis of melting temperature of fingerprinting products
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Branch programm of research of the Ministry of Health
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví 2 (SMZ02005NR)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NR8365-5/2005
Alternative language
Project name in Czech
Druhová identifikace patogenních kvasinek založená na analýze teploty tání produktů fingerprintingu
Annotation in Czech
Vývoj nové metody konečné druhové identifikace patogenních kvasinek, založené na analýze výsledků fingerprintingu kvasinkových izolátů pomocí odečtu teplot tání produktů PCR z křivky tání reakční směsi po skončení PCR. Pořízení veřejně přístupné databázevýsledků metody a vývoj software pro usnadnění analýzy výsledků metody, obojí umožňující mezilaboratorní srovnání a univerzální použití metody k identifikaci kvasinek v mykologických laboratořích. Zhodnocení citlivosti, specifity a vypovídací schopnostimetody ve srovnání se dvěma fenotypizačními technikami (předběžná identifikace pomocí CHROMagaru a konečná identifikace pomocí systému ID 32C) v průběhu prospektivní studie v rutinním provozu.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
McRAPD data for species identification of patogenic yeasts were stored in a public database including a processing freeware. Accurate species identification rate of an easy, rapid and economic semi-autmated McRAPD achieved 97,8%.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Jun 30, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 5, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-MZ0-NR-U/03:3
Data delivery date
Apr 27, 2011
Finance
Total approved costs
2,823 thou. CZK
Public financial support
2,477 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
336 thou. CZK