Genomic analysis of antibiotic multiresistance in a global epidemic clone of Acinetobacter baumannii.
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Ministry of Health?s Departmental Research and Development Programme III
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 4 (SMZ0201301)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NT14466-3/2013
Alternative language
Project name in Czech
Genomová analýza antibiotické multirezistence u globálního epidemického klonu Acinetobacter baumannii.
Annotation in Czech
Acinetobacter baumannii je významný bakteriální patogen způsobující obtížně léčitelné nemocniční infekce. Celosvětový problém antibiotické multirezistence u tohoto patogenu má významnou souvislost s rozšířením konkrétní epidemické linie, tzv. Evropského klonu II (EK II), jenž dlouhodobě převažuje také mezi multirezistentními kmeny acinetobakterů v ČR. Cílem projektu je poznání genetických faktorů zodpovědných za pokračující vývoj rezistence u tohoto klonu. Východiskem projektu bude srovnávací materiál zahrnující multirezistentní izoláty reprezentující současnou i historickou nemocniční populaci A. baumannii v ČR a dalších zemí. Faktory zodpovědné za vývoj multirezistence budou studovány na nemocničních a laboratorních liniích izogenních izolátů EK II s různým rezistotypem pomocí moderních postupů strukturální a funkční genetické analýzy včetně populačně-genetické analýzy, celogenomové srovnávací analýzy, a kvantifikace genové exprese mechanizmů rezistence na úrovni transkripce a enzymové aktivity.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project describes a novel mechanisms of antibiotic resistance of Acinetobacter baumannii; namely through the action of the beta lactamase TEM-1. The work contains also thorough genomic characterization of the whole genus.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 20, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MZ0-NT-U/02:1
Data delivery date
Dec 19, 2016
Finance
Total approved costs
2,975 thou. CZK
Public financial support
2,928 thou. CZK
Other public sources
46 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK