Exosomal long non-coding RNAs as non-invasive biomarkers for early detection of colorectal cancer
Project goals
Colorectal cancer (CRC) is one of the most common cancers worldwide and the main cause of cancer related deaths due to the late diagnosis. Thus, there is a high demand for non-invasive biomarkers that would enable early detection of CRC. Recently, several studies have proven the presence of long non-coding RNAs (lncRNAs) in body fluids and confirmed their diagnostic potential. In addition, lncRNAs were found to be secreted into circulation via exosomes that are endogenously produced by cancer cells and participate in intercellular communication. The main aim of proposed study is to analyze global expression profiles of lncRNAs in blood serum of CRC patients/controls and establish diagnostic panel of lncRNA enabling the early detection of CRC and precancerous lesions. The extensive validation of panel will be performed using independent retrospective/prospective sets of patients/controls and its diagnostic sensitivity/specificity will be compared with currently used biomarkers. The source of identified exosomal lncRNAs in serum will be determined using in vitro and in vivo models.
Keywords
Kolorektální karcinomColorectal cancerexozómyexosomesdlouhé nekódující RNAlong non-coding RNAsdiagnostický biomarkerdiagnostic biomarkerexpresní profilováníexpression profiling
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202000001
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU20-03-00127
Alternative language
Project name in Czech
Dlouhé nekódující RNA v exozómech jako biomarkery umožňující neinvazivní časnou detekci kolorektálního karcinomu
Annotation in Czech
Kolorektální karcinom (CRC) patří mezi nejčastější nádorová onemocnění a obsazuje přední místa z hlediska mortality. Jedním z důvodů vysoké úmrtnosti je pozdní diagnostika. Cílem současného výzkumu je identifikovat neinvazivní biomarkery, jež by umožnily časnou detekci onemocnění. Nedávné studie prokázaly přítomnost dlouhých nekódujících RNA (lncRNA) v tělních tekutinách a poukázaly na jejich diagnostický potenciál. Zároveň bylo zjištěno, že velká část těchto molekul se do cirkulace dostává uvnitř exozomů, jež jsou vylučovány nádorovými buňkami a podílí se na mezibuněčné komunikaci. Hlavním cílem studie je stanovit expresní profily lncRNA v krevním séru pacientů s CRC a v séru kontrolních osob a následně sestavit diagnostický panel lncRNA umožňující časnou detekci CRC a prekancerózních lézí. Získaný panel bude podroben rozsáhlé validaci na retrospektivním i prospektivním souboru pacientů a kontrol a jeho diagnostická senzitivita a specificita bude porovnána se současně používanými biomarkery. Původ exozomálních lncRNA v krevním séru bude stanoven s využitím in vitro a in vivo analýz.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Apr 28, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NU-R
Data delivery date
Feb 21, 2024
Finance
Total approved costs
12,766 thou. CZK
Public financial support
12,533 thou. CZK
Other public sources
20 thou. CZK
Non public and foreign sources
213 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
12 766 CZK thou.
Public support
12 533 CZK thou.
98%
Provider
Ministry of Health
OECD FORD
Oncology
Solution period
01. 05. 2020 - 31. 12. 2024