TUMOR CELL AND MUTATIONAL LANDSCAPE IN COLORECTAL CANCER DEVELOPMENT

Provider

Ministry of Health

Programme

—

Call for proposals

SMZ0202100001

Main participants

Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

NU21-03-00506

Project name in Czech

VÝZNAM MUTAČNÍHO SPEKTRA NÁDOROVÝCH BUNĚK VE VÝVOJI KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU

Annotation in Czech

Růst a šíření nádoru jsou pod kontrolou mikroprostředí nádoru, které obsahuje buňky imunitního systému a další typy buněk přítomné i v chronických zánětlivých procesech. V nedávné době byla zavedena nová metoda, tzv. imunoskore, pro odhad prognózy pacientů s kolorektálním karcinomem (CRC), založená na kvantifikaci dvou typů protinádorových T-lymfocytů (CD3+ a CD8+) v primárním CRC. Ukázalo se, že imunoskore poskytuje lepší prognostickou předpověď než tradiční klasifikace TNM. Imunoskore však nelze použít u pacientů se vzdálenými metastázami (stadium IV), tedy pacientů s nejhorší prognózou, u kterých je odhad dalšího vývoje stěžejní. Zavedení nových prognostických biomarkerů pro CRC je brzděn nedostatkem velkých souborů, které by zahrnovaly vzorky normální sliznice, primárního nádoru a metastáz od stejného jedince. Naším cílem je přehodnotit využití nádorového mikroprostředí při hodnocení prognózy u pacientů s CRC a zahrnout nově také pacienty se vzdálenými metastázami při tvorbě nové prognostické metody založené na detekci a kvantifikaci 11 typů buněk v mikroprostředí nádoru. V hodnocení bude jako nový marker navíc zohledněna délka telomer stanovaná ve vybraných oblastech tkáně, protože právě délka telomer je spojena s mnoha procesy v karcinogenezi. Mezinárodně jedinečný soubor 160 pacientů s dostupnými vzorky normální sliznice, primárního nádoru a jaterních metastáz je pro tuto studii již k dispozici. U poloviny těchto pacientů byly jaterní metastázy přítomny již při diagnóze (stádium IV), zatímco u druhé poloviny pacientů došlo k metastatickému rozšíření později (stádia II / III). Díky této studii poprvé zmapován imunitní profil normální sliznice tlustého střeva v porovnání s primárním CRC a jaterními metastázemi z hlediska distribuce jednotlivých buněčných typů a délky telomer. Do studie bude kromě CD3 + a CD8 + T-lymfocytů zahrnuto dalších 9 typů buněk, čímž hodláme vylepšit současné imunoskore, a to s možností zahrnutí také skóre založeného na délce telomer.

R&D category

AP - Applied research

OECD FORD - main branch

30204 - Oncology

OECD FORD - secondary branch

—

OECD FORD - another secondary branch

—

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

FD - Oncology and haematology

Provider evaluation

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Project results evaluation

The scientific contribution of the project lies in elucidating the role of the immune microenvironment in the progression and metastasis of colorectal cancer and in identifying new prognostic biomarkers. The results achieved are consistent with the project’s scientific focus and are adequately supported by published works. The project has potential significance for clinical practice, particularly in the area of prognostic stratification of patients and the development of personalized medicine, and has also contributed to the professional development of young researchers. The project’s outputs include high-quality publications in international peer-reviewed journals and presentations at scientific conferences. The project deviated from the original plan due to a lower number of patients ultimately analyzed and a delay in the telomere component; however, this did not affect the achievement of the main objectives. No serious shortcomings were identified in the fulfillment of the project s

Realization period - beginning

May 1, 2021

Realization period - end

Dec 31, 2025

Project status

U - Finished project

Latest support payment

Mar 4, 2025

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP26-MZ0-NU-U

Data delivery date

Jul 13, 2026

Total approved costs

13,070 thou. CZK

Public financial support

13,070 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK