Explaining metastatic potential of colorectal cancer through whole-exome sequening and immune cell and telomere landscape
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-05609S
Alternative language
Project name in Czech
Objasnění metastatického potenciálu kolorektálního karcinomu pomocí celoexomového sekvenování a profilu imunitních buněk a telomer
Annotation in Czech
Tento projekt zaměřený na celoexomové sekvenování využívá mezinárodně unikátní soubor vzorků kolorektálního karcinomu (CRC, N=100) a jaterních metastáz od stejných pacientů. Hledáme funkční mutace a mutační podpisy spojené s metastatickým procesem. Hodnoceny budou také počty mutací (nádorová mutační zátěž), spojené s aktivací protinádorových imunitních buněk. Tuto hypotézu máme možnost přímo otestovat v probíhajícím projektu na stejných vzorcích CRC, pro které jsou stanoveny hustoty příslušných imunitních buněk. Sledovat budeme i zkracování telomer, jejichž funkce je u většiny novotvarů narušena. Naše skupina vzorků obsahuje páry primárních nádorů a metastáz od stejných pacientů s CRC, což spolu s detailními klinickými daty umožní robustní analýzu mutací, mutačních podpisů a nádorové mutační zátěže a významně přispěje k vysvětlení genetického původu metastáz. Unikátnost této studie spočívá také v tom, že tematicky propojuje výzkum mutací souvisejících s nádorem s obsahem imunitních buněk v mikroprostředí nádoru, přičemž oba tyto faktory mohou být klíčové pro výsledek léčby pacientů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
30204 - Oncology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FD - Oncology and haematology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 24, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
12,152 thou. CZK
Public financial support
12,152 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK