Genetic and protein markers of pulmonary and extrapulmonary subtypes of small cell neuroendocrine cancer: Prognostic correlations of the disease.
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202200001
Main participants
Fakultní Thomayerova nemocnice
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU22-03-00130
Alternative language
Project name in Czech
Genové a proteinové markery subtypů primárně plicního a mimoplicního malobuněčného neuroendokrinního karcinomu: Prognostické korelace onemocnění.
Annotation in Czech
High grade malobuněčný neuroendokrinní karcinom (SCC) je vysoce maligní nádor s extrémně špatnou prognózou. Většina nádorových lézí pochází primárně z plicního parenchymu (SCLC), existují však i méně časté případy (SCC) s primárním výskytem v jiných orgánech mimo plíce (ESCC). Recentně byly publikovány studie dokazující, že SCC není homogenní nádorová entita, ale že jej lze na základě expresního profilu markerů rozdělit na několik podjednotek. Tyto poznatky dosud nebyly implementovány do běžné diagnostické a klinické praxe, protože chybí korelace morfologických a genomických dat s prognostickými a prediktivními faktory umožňujícími stratifikovat pacienty různých podtypů SCLC k odlišným modalitám léčby. Na základě odlišnosti histologických, fenotypových, genových a proteinových markerů a rozdílů v přežívání předpokládáme odlišné spektrum aberací v genomu jednotlivých podtypů SCLC i ESCC. Cílem projektu je zmapovat spektrum molekulárních změn užitím širokého panelu kanonických genových aberací a změn exprese mRNA genů asociovaných s proteinovými biomarkery neuroendokrinní diferenciace specifickými pro jednotlivé subtypy malobuněčného karcinomu, zejména se zaměřením na INSM1, CD56, TTF-1, SYP, chromogranin, p16, P53, P73, ASCL1, DLL3, NEUROD1, YAP1, POU2F3 a potenciálně využitelných biomarkerů pro moderní biologickou protinádorovou léčbu (např. PD-L1, N-TRK, FGFR, MSI). Do studie bude zařazeno 200 případů SCLC a 200 případů ESCC, u nichž je dostupná fixovaná a parafinově zpracovaná nádorová tkáň a zároveň budou dostupná retrospektivní klinická data. Vzhledem k možným technickým problémům spojeným se získáváním validních vzorků je pro zvětšení studované kohorty plánována spolupráce nejen mezi pracovištěm řešitele (FTN) a spoluřešitele (VFN), ale i dalších předních onkopatologických pracovišť v rámci České republiky (FNKV, MOÚ, FN Ostrava a Bioptická laboratoř Plzeň). V rámci odborné spolupráce se do projektu zapojí i pracoviště zahraničního partnera z Atlanty, USA
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30109 - Pathology
OECD FORD - secondary branch
30204 - Oncology
OECD FORD - another secondary branch
20602 - Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FD - Oncology and haematology<br>FP - Other medical fields<br>FS - Medical facilities, apparatus and equipment
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Apr 12, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MZ0-NU-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
18,675 thou. CZK
Public financial support
18,675 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK