Analysis of interactions between tumor cells and microenvironment using mass cytometry and protein arrays
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)
Main participants
Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-26588A
Alternative language
Project name in Czech
Analýza interakcí nádorových buněk s mikroprostředím metodami hmotnostní cytometrie a proteinových arrays
Annotation in Czech
Projekt vytvoří technologickou platformu pro výzkum komplexních tekutých tkání (periferní krev, kostní dřeň a CUSA aspirát) které jsou infiltrovány nádorovými buňkami. Přístup kombinuje dvě inovativní datově bohaté technologie: hmotnostní cytometrii („nádorová cytomika“), která zjišťuje změny v buněčném zastoupení infiltrovaných tkání a SEC-MAP array („proteomika“), která zjišťuje změny v proteomu nádorových buněk. Nejprve zmapujeme normální vývoj B-lymfocytů rezidentních v kostní dření, ke kterému bude možné vztahovat nádorem způsobené abnormity (potenciální biomarkery). Na modelu leukemických buněk a buněk mozkových nádorů dále určíme změny proteomu při maligním zvratu metodou SEC-MAP arrays. V další fázi budou biomarkery zabudované do panelů vyšetřovaných hmotnostní cytometrií („nádorová cytomika“). Vyvineme bioinformatické nástroje pro porozumění vzniklým vysoce kompexním datům.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FD - Oncology and haematology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project has led to development, evaluation, and implementation of new techniques built on flow cytometry, mass spectrometry, and proteomics. In particular, the technique for isolation of cells for mass cytometric analyses based on the expression of CD81 was produced, analysis of more than 100 CD markers on 47 cell populations obtained from blood, thymus, and tonsils was achieved, about 500 different antigens were analyzed in several tens of samples of leukemic cells, and panel of 35 markers for mass cytometric analyses was developed to distinguish among types of leukocytes. These and other results are fully adequate and there are no doubts about their scientific and clinical significance. The results are typical by their high level of applicability in cell biology and clinical medicine. The project produced tree publications in high visibility journals ant its result were also presented on several conferences. The project was solved in consonance with agency rules.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-MZ0-NV-U/02:1
Data delivery date
Sep 16, 2019
Finance
Total approved costs
18,817 thou. CZK
Public financial support
18,817 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK