All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Analysis of interactions between tumor cells and microenvironment using mass cytometry and protein arrays

Public support

  • Provider

    Ministry of Health

  • Programme

    Programme to support medical applied research in 2015 to 2022

  • Call for proposals

    Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)

  • Main participants

    Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    15-26588A

Alternative language

  • Project name in Czech

    Analýza interakcí nádorových buněk s mikroprostředím metodami hmotnostní cytometrie a proteinových arrays

  • Annotation in Czech

    Projekt vytvoří technologickou platformu pro výzkum komplexních tekutých tkání (periferní krev, kostní dřeň a CUSA aspirát) které jsou infiltrovány nádorovými buňkami. Přístup kombinuje dvě inovativní datově bohaté technologie: hmotnostní cytometrii („nádorová cytomika“), která zjišťuje změny v buněčném zastoupení infiltrovaných tkání a SEC-MAP array („proteomika“), která zjišťuje změny v proteomu nádorových buněk. Nejprve zmapujeme normální vývoj B-lymfocytů rezidentních v kostní dření, ke kterému bude možné vztahovat nádorem způsobené abnormity (potenciální biomarkery). Na modelu leukemických buněk a buněk mozkových nádorů dále určíme změny proteomu při maligním zvratu metodou SEC-MAP arrays. V další fázi budou biomarkery zabudované do panelů vyšetřovaných hmotnostní cytometrií („nádorová cytomika“). Vyvineme bioinformatické nástroje pro porozumění vzniklým vysoce kompexním datům.

Scientific branches

  • R&D category

    AP - Applied research

  • CEP classification - main branch

    FD - Oncology and haematology

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    The project has led to development, evaluation, and implementation of new techniques built on flow cytometry, mass spectrometry, and proteomics. In particular, the technique for isolation of cells for mass cytometric analyses based on the expression of CD81 was produced, analysis of more than 100 CD markers on 47 cell populations obtained from blood, thymus, and tonsils was achieved, about 500 different antigens were analyzed in several tens of samples of leukemic cells, and panel of 35 markers for mass cytometric analyses was developed to distinguish among types of leukocytes. These and other results are fully adequate and there are no doubts about their scientific and clinical significance. The results are typical by their high level of applicability in cell biology and clinical medicine. The project produced tree publications in high visibility journals ant its result were also presented on several conferences. The project was solved in consonance with agency rules.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    May 1, 2015

  • Realization period - end

    Dec 31, 2018

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Jun 28, 2018

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP19-MZ0-NV-U/02:1

  • Data delivery date

    Sep 16, 2019

Finance

  • Total approved costs

    18,817 thou. CZK

  • Public financial support

    18,817 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK