All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Proteomic analysis of medulloblastoma molecular subgroups: discovery of novel clinically relevant markers

Public support

  • Provider

    Ministry of Health

  • Programme

    Programme to support medical applied research in 2015 to 2022

  • Call for proposals

    Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)

  • Main participants

    Fakultní nemocnice Brno

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    15-30657A

Alternative language

  • Project name in Czech

    Proteomická analýza molekulárních podtypů meduloblastomu: odhalení klinicky významných markerů

  • Annotation in Czech

    Deset procent úmrtí dětí se solidními nádory je způsobeno meduloblastomem. Současná molekulární klasifikace meduloblastomu má prognostický význam. Je však založena na analýze transkriptomu, což je v běžné diagnostické praxi nákladné a jen obtížně realizovatelné. Proto v navrhovaném projektu aplikovaného výzkumu plánujeme využít kvantitativní proteomiku k identifikaci a validaci nových proteinových markerů recentně identifikovaných molekulárních podskupin meduloblastomu (tj. WNT, SHH, skupina 3, skupina 4). Proteiny se vztahem k rozdílné klinické prezentaci a prognóze onemocnění plánujeme odhalit i uvnitř jednotlivých podskupin. Součástí projektu je také ověření naší hypotézy o podílu tetraspaninů a dalších membránových proteinů (např. chloride intracellular channel 1) v patogenezi meduloblastomu a o jejich rozdílné expresi mezi podskupinami. Předpokládané výsledky poslouží k vývoji robustních a spolehlivých imunohistochemických testů pro rutinní diagnostiku molekulárních podskupin meduloblastomu a jsou východiskem pro vývoj cílené léčby meduloblastomu zaměřené na membránové protei...

Scientific branches

  • R&D category

    AP - Applied research

  • CEP classification - main branch

    FG - Paediatrics

  • CEP - secondary branch

    FD - Oncology and haematology

  • CEP - another secondary branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology<br>30209 - Paediatrics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena

  • Project results evaluation

    The authors identified protein markers in molecular subgroups of medulloblastoma using quantitative proteomic profiling. Unfortunately they had to reanalysed the already achieved results using different sofware for bioinformatics in 2018. The preparation of the publication presenting the results of a project was due to this fact delayed and not yet accepted for publication. The original hypotheses about the validation of identified targets on medulloblastoma using immunohistochemical staining of FFPE tissues and functional analyses using medulloblastoma derived cell lines were not proven.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    May 1, 2015

  • Realization period - end

    Dec 31, 2018

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Jun 28, 2018

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP19-MZ0-NV-U/01:1

  • Data delivery date

    Jun 28, 2019

Finance

  • Total approved costs

    7,366 thou. CZK

  • Public financial support

    7,366 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK