Proteomic analysis of medulloblastoma molecular subgroups: discovery of novel clinically relevant markers
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)
Main participants
Fakultní nemocnice Brno
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-30657A
Alternative language
Project name in Czech
Proteomická analýza molekulárních podtypů meduloblastomu: odhalení klinicky významných markerů
Annotation in Czech
Deset procent úmrtí dětí se solidními nádory je způsobeno meduloblastomem. Současná molekulární klasifikace meduloblastomu má prognostický význam. Je však založena na analýze transkriptomu, což je v běžné diagnostické praxi nákladné a jen obtížně realizovatelné. Proto v navrhovaném projektu aplikovaného výzkumu plánujeme využít kvantitativní proteomiku k identifikaci a validaci nových proteinových markerů recentně identifikovaných molekulárních podskupin meduloblastomu (tj. WNT, SHH, skupina 3, skupina 4). Proteiny se vztahem k rozdílné klinické prezentaci a prognóze onemocnění plánujeme odhalit i uvnitř jednotlivých podskupin. Součástí projektu je také ověření naší hypotézy o podílu tetraspaninů a dalších membránových proteinů (např. chloride intracellular channel 1) v patogenezi meduloblastomu a o jejich rozdílné expresi mezi podskupinami. Předpokládané výsledky poslouží k vývoji robustních a spolehlivých imunohistochemických testů pro rutinní diagnostiku molekulárních podskupin meduloblastomu a jsou východiskem pro vývoj cílené léčby meduloblastomu zaměřené na membránové protei...
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FG - Paediatrics
CEP - secondary branch
FD - Oncology and haematology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology<br>30209 - Paediatrics
Completed project evaluation
Provider evaluation
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Project results evaluation
The authors identified protein markers in molecular subgroups of medulloblastoma using quantitative proteomic profiling. Unfortunately they had to reanalysed the already achieved results using different sofware for bioinformatics in 2018. The preparation of the publication presenting the results of a project was due to this fact delayed and not yet accepted for publication. The original hypotheses about the validation of identified targets on medulloblastoma using immunohistochemical staining of FFPE tissues and functional analyses using medulloblastoma derived cell lines were not proven.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-MZ0-NV-U/01:1
Data delivery date
Jun 28, 2019
Finance
Total approved costs
7,366 thou. CZK
Public financial support
7,366 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK