Childhood-onset diabetes in sub-Saharan Africa: genetic and virological findings in Nigeria, and their comparison to European populations
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)
Main participants
Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-31426A
Alternative language
Project name in Czech
Dětský diabetes v subsaharské Africe: genetické a virologické nálezy a jejich srovnání s evropskými populacemi
Annotation in Czech
Enterovirus je podezírán z podílu na etiologii diabetu 1. typu, ale dostupné studie se omezují zejména na europoidní populace mírného pásu. Nic není známo o černošských populacích žijících v subsaharském tropickém klimatu, ačkoli tamní sezónnost manifestace diabetu během sušších a deštivých částí roku naznačuje podíl infekční složky na etiologii onemocnění. Provedeme studii případů a kontrol, kde vyšetříme enteroviry a další prevalentní enterické viry u 150 čerstvě manifestovaných diabetických dětí a 300 spárovaných kontrol. Nejprve stanovíme nejčastější virové druhy pomocí paralelní sekvenace viromu u podskupiny vzorků stolic, poté u všech dětí provedeme PCR detekce z krve a stolice na tyto prevalentní druhy. Z genetických faktorů vyšetříme geny HLA-DQ, IFIH1, PTPN22 a INS. K stanovení determinant rizika diabetu 1. typu užijeme regresních metod. Vedlejším výsledkem projektu bude první nigerijská sbírka vzorků diabetických dětí a přenos technologií do Nigérie.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project brings original results which are also the first ones in the international context, of microbiome from 4 African and Asian countries.They describe actual virome and bacteriome in the recent Type 1 diabetic patients in comparison with the healthy persons. The results are characterisized by high precision done in the analyses. Quality of results are documented by their citations abroad although they were published in the last two years. The project brings valuable data not only for diabetology but for epidemiology, hygiene or genetics as well. The project brings 4 publications in the international journals with IF. The results were introduced at the international congresses. The incorporation of the results into the large international study demonstrates the quality of the research team. All methods were properly confirmed and no defects in the realization of the project have been found. Globally, the project offers excellent and original data and therefore it may be qua
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-MZ0-NV-U/01:1
Data delivery date
Jun 28, 2019
Finance
Total approved costs
7,040 thou. CZK
Public financial support
7,040 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK