Characteristics of isolates of Giardia intestinalis, a causative agent of the most common intestinal protozoan infection, as diagnostic tools
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-33369A
Alternative language
Project name in Czech
Využití vlastností izolátů Giardia intestinalis, původce nejběžnější střevní protozoární nákazy, pro diagnostiku
Annotation in Czech
Giardióza je globálně rozšířená parazitární nákaza, kterou vyvolává bičíkovec Giardia intestinalis. Toto průjmovité onemocnění, byť není fatální, významně přispívá k malnutrici zejména u dětí třetího světa. V rozvinutých zemích se vyskytují importované, ale i autochtonní případy nákazy. V České republice giardióza představuje nejčastější střevní protozoární nákazu s víc jak 200 případy ročně. V poslední době narůstá počet případů, zejména u cestovatelů po návratu z Indie, které neodpovídají na běžné dávkování metronidazolu. Tento projekt má za cíl vytvořit biobanku klinických izolátů giardií a testovat in vitro jejich citlivost k metronidazolu (MTZ), nejběžnějšímu léku proti giardióze, shromáždit izoláty k MTZ citlivé a rezistentní, charakterizovat jejich karyotypy a genotypy a s pomocí celogenomové sekvenace se pokusit identifikovat mezi nimi rozdíly, které by mohly sloužit jako základ pro PCR diagnostiku případů giardiózy rezistentních k MTZ.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The issue of antibiotic resistance is highly relevant in microbes, but is also becoming more important in parasitic diseases. The aim of the project was to characterize clinically resistant giardias and to identify metronidazole resistant giardias by in vitro testing. The objectives of the project were fulfilled, exceeded in the publication part. During the project, a biobank of G. intestinalis isolates was created, ready for further use. Genotyping was carried out to describe giardias isolated in the Czech Republic. The typing has showed that metronidazole resistance does not correlate with the genotype (or karyotype) of giardia. Using genotyping the first zoonotic transmission of giardias from assemblage B was also described and demonstrated their zoonotic potential (another project outcome). Clinical resistance to metronidazole has been found to not always correlate with the results of in vitro testing; A unique SNP typical in resistant isolates has been identified by genomic sequen
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-MZ0-NV-U/01:1
Data delivery date
Jun 28, 2019
Finance
Total approved costs
8,134 thou. CZK
Public financial support
8,134 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK