Molecular epidemiology of listeriosis using the next generation sequencing approach
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 2 (SMZ0201601)
Main participants
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-31488A
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární epidemiologie listerióz s využitím metod sekvenace nové generace
Annotation in Czech
Šetření epidemií listerióz je obtížnější než šetření ostatních alimentárních onemocnění, a to zejména kvůli delší inkubační době onemocnění, nízkému počtu případů, velkému geografickému rozptýlení nemocných a komplikované komunikaci s postiženými a jejich příbuznými při hledání vehikula infekce. Technologie založené na analýze genetických charakteristik kmenů jsou zásadním epidemiologickým nástrojem v oblasti prevence a kontroly listerióz. V rámci projektu budou k typizaci kmenů používány jak standardní, tak i nové laboratorní techniky. Tento nový metodologický přístup umožní zefektivnění práce epidemiologů v ČR a posílí spolupráci s ostatními evropskými zeměmi v oblasti molekulární epidemiologie a inter-laboratorní výměny dat.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project created unique collection of human, food and environmental isolates of L. monocytogenes in the Czech Republic since 2013. For the detection new generation sequencing methods were used. The obtained results were used for epidemiological purposes to follow circulation and pathogenic potential of L. monocytogenes strains in the Czech Republic. Results were published in 6 papers in journals with IF (IF = 6.66), 2 papers in Czech journals, as well as were presented at 10 international and 8 domestic conferences, also organized a seminar for the Ministry of Health. Thanks to these results they could participate in the consortium of project Horizon 2020. Obtained knowledge is significant for the Czech Republic as well as internationally. Therefore, this project may be judged as outstanding.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-MZ0-NV-U/03:1
Data delivery date
Jul 1, 2020
Finance
Total approved costs
5,513 thou. CZK
Public financial support
5,513 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK