Polymicrobial biofilm - the complex microbiome - in relation to the treatment of nosocomial infections
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 2 (SMZ0201601)
Main participants
Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-31593A
Alternative language
Project name in Czech
Polymikrobiální biofilm jako komplexní mikrobiom v rámci léčby nozokomiálních infekcí
Annotation in Czech
Množství katétrových infekcí krevního řečiště stále stoupá. 30-40 % nozokomiálních infekcí tvoří právě katétrové infekce a jsou významným faktorem komplikujícím léčbu pacienta. Tyto infekce mohou vést k opakovaným chirurgickým intervencím, s čímž souvisí vyšší náklady na léčbu či zvýšená mortalita. Schopnost určit příčinu infekce je nezbytná pro úspěšnou léčbu, nicméně mikrobiální diverzita smíšených biofilmů komplikuje diagnostiku a léčbu a nebyla dosud zcela prostudována. Kromě kultivačnícvh metod je nutné využít a optimalizovat i metody genetické, např. ARISA, T-RFLP, DGGE či NGS. Očekávanými výsledky jsou zlepšení a zrychlení diagnostiky a monitoring infekčního procesu pro racionální ATB léčbu, či modifikaci ATB léčby se zaměřením na rezistentní mikroby a složení polymikrobiálního biofilmu.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project revealed a novelty in the study of polymicrobial biofilms as a cause of bloodstream catheter-related infections. Due to the fact that these are very common and serious nosocomial infections, the results of the project are beneficial for routine clinical practice. Within a project, a number of methodological approaches for the detection of polymicrobial biofilm were used, their sensitivity and specificity and possibilities of routine use were evaluated. The molecular method (T-RFLP) proved to be the most suitable for the diagnosis of polymicrobial biofilm, on the contrary, the complexity of the NGS method proved to be limiting for routine practice. The results of the project pointed out problems in the diagnostics of catheter-related infections, which may be caused to the overestimation of the finding of cutibacteria or, conversely, the absence of detection of anaerobic bacteria. The project brought valuable scientific results with direct use for practice. A total of 11 impa
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-MZ0-NV-U/03:1
Data delivery date
Jul 1, 2020
Finance
Total approved costs
11,817 thou. CZK
Public financial support
11,327 thou. CZK
Other public sources
490 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK