Clinical Aspects of Multidrug-Resistant Infections Caused by Gram-negative Bacteria Using a Clinically Relevant Large Mammal Model of Sepsis
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 3 (SMZ0201701)
Main participants
Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-29239A
Alternative language
Project name in Czech
Klinické aspekty multirezistentních infekcí způsobených gramnegativními bakteriemi studované na klinicky relevantním modelu sepse
Annotation in Czech
V poslední době dochází k celosvětovému šíření antibiotické rezistence. Cílem předkládaného projektu je studium mechanizmů klinicky významné antibiotické rezistence enterobakterií pomocí MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie a Ramanovy spektroskopie na klinicky relevantním modelu sepse (prasečí model). Budou vyvinuty nové spektrometrické metody, které by měly napomoci k objasnění chování beta-laktamáz v bakteriální buňce během infekce. Tyto metody napomohou k ustavení vhodných interpretačních kritérií při vyšetření citlivosti na antibiotika. Běhemm řešení budou použity epidemicky úspěšné klony enterobakterií, které budou detailně charakterizovány pomocí celogenomové sekvenace. Zároveň bude vyvinut vhodný animální model, který umožní získat dostatečnou koncentraci bakterií v klinickém vzorku (např. peritonitida). Budou rovněž validovány metody fixace a transportu klinického materiálu do laboratoře tak, aby byly vhodné pro výše uvedené analýzy. Zmíněné techniky umožní lépe pochopit patogenezi infekcí způsobených bakteriemi produkujícími beta-laktamázy.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
FE - Other fields of internal medicine
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>30217 - Urology and nephrology<br>30218 - General and internal medicine<br>30219 - Gastroenterology and hepatology<br>30220 - Andrology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project was focused on the development of an experimental porcine model of sepsis, induced by multiresistant microbes (carbapenemase producers and colistin-resistant) of Enterobacterales order. This model was successfully developed and was used to simulate sepsis caused by multiresistant microbes from the Enterobacterales order. Bacterial variants with defined resistance profiles were developed and used for the inoculation of the pigs. Collected samples were analysed biochemically, microbiologically and by RNA sequencing. Microbiome analyses of the experimental animals were performed. Moreover, the molecular epidemiology study of clinically significant carbapenemase producers and colistin-resistant isolates from the order Enterobacterales was realised. New methods have been established, such as microbiome analysis and RNAseq. The results of this project were published in 14 papers in high-quality journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-MZ0-NV-U/03:1
Data delivery date
Jun 25, 2021
Finance
Total approved costs
7,065 thou. CZK
Public financial support
7,065 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK