Proteomic analysis of myocardium in advance heart failure patients- identification of biomarkers facilitating clinical decisions

Provider

Ministry of Health

Programme

Programme to support medical applied research in 2015 to 2022

Call for proposals

Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)

Main participants

Institut klinické a experimentální medicíny

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

NV19-02-00130

Project name in Czech

Proteomická analýza myokardu pokročilého srdečního selháni- identifikace biomarkerů podporujících klinické rozhodování

Annotation in Czech

Pokročilé srdeční selhání je spojeno s velmi špatnou prognózou a zároveň spotřebovává největší část zdrojů pro léčbu tohoto onemocnění. Pokročilé srdeční selhání je velmi často biventrikulární – je přítomna dysfunkce nejen levé (LK), ale i pravé komory (PK). Predikce rozvoje dysfunkce pravé komory v kontextu levostranného selhání je obtížná, ale je kriticky důležitá pro správné načasování terapií jako jako transplantace srdce nebo implantace podpory levého srdce (LVAD). Cílem projektu je identifikovat bílkoviny diferenciálně exprimované v myokardu pacientů s biventrikulárním selháním oproti pacientům se srdečním selháním a zachovalou funkcí PK a kontrolám (orgánoví dárci). Současné proteomické techniky umožňují identifikaci až 10 000 proteinů, což téměř odpovídá počtu proteinů v běžné buňce. Detekce takových proteinů v krvi by byla užitečným nástrojem podporující klinické rozhodování. Identifikace diferenciálně exprimovaných proteinů může hrát roli nejen pro diagnostiku nebo pro zpřesnění odhadu prognózy, ale může také vést k identifikaci nových terapeutických cílů. Bude provedena detailní proteomická analýza směsných vzorků myokardu pacientů, kteří podstoupili transplantaci (Tx) srdce („discovery“ kohorta) a kontrol. Budou porovnány vzorky pacientů s normální funkcí PK (horní kvartil ditribuce funkce PK) a s dysfunkcí PK (dolní kvartil distribuce funkce PK). Diferenciální exprese identifikovaných proteinů bude následně verifikována v individuálních vzorcích myokardu původní i další kohorty Tx pacientů (verifikační kohorta). Verifikovaný a prioritizovaný seznam potenciálních markerů bude dále testován na přítomnost a změny koncentrace v séru pacientů obou kohort. Schopnost takto verifikovaných potenciálních biomarkerů predikovat přítomnost biventrikulárního selhání bude dále studována na preexistujícím setu pacientů s pokročilým srdečním selháním podstupujících podrobné vyšetření v IKEM, na této kohortě bude rovněž testována schopnost biomarkerů predikovat prognóz

R&D category

AP - Applied research

OECD FORD - main branch

30201 - Cardiac and Cardiovascular systems

OECD FORD - secondary branch

—

OECD FORD - another secondary branch

—

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

FA - Cardiovascular diseases including cardio-surgery

Provider evaluation

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Project results evaluation

This very ambitious project fulfilled main aims and brought also a scientifically very valuable result - a possible novel marker of right heart failure. This outcome has not yet been published. The grant, however, brought 3 from 3 promissed experimental IF (Jimp) papers in relation to the topic and is hence accomplished. The final report needs to be adjusted and supplemented. It is unlogically devalued by information on 5 papers, which were dedicated to this grant, 4 of them are related to heart failure but none of them to the topic of this grant. These publications cannot be accepted as outcomes of this project. Also a formal explanation why the number of human samples for specific aims 1 and 2 were lower as originally planned.

Realization period - beginning

May 1, 2019

Realization period - end

Dec 31, 2022

Project status

U - Finished project

Latest support payment

Apr 19, 2022

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP23-MZ0-NV-U

Data delivery date

Jun 22, 2023

Total approved costs

11,116 thou. CZK

Public financial support

11,116 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK