Comparative transcriptomic analysis of regeneration in head and neck cancer as a new strategy to search cancer prognostic markers
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202400001
Main participants
Fakultní nemocnice Královské Vinohrady
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NW24-03-00459
Alternative language
Project name in Czech
Komparativní transkriptomická analýza regenerace u rakoviny hlavy a krku jako nová strategie hledání prognostických markerů rakoviny
Annotation in Czech
Nedávno zavedené vysokokapacitní profilování exprese na úrovni jednotlivých buněk přináší revoluci v našem chápání biologických procesů za normálních i patologických situacích. Týmem byly recentně identifikovány a popsány nové typy buněk a regulačních sítí, které mohou mít slibné aplikace pro molekulární charaketrizaci a prognstifikaci včetně odhadu efektu na léčebu. Náš projekt vychází z pilotní studie, v níž jsme na modelu embryí Xenopus identifikovali přechodné buňky iniciující regeneraci. Překvapivě se jejich expresní profil překrývá se subpopulací maligních buněk nalezených u dlaždicových karcinomů hlavy a krku. Naším cílem je analyzovat lokalizaci těchto buněk v nádorech pacientů a otestovat jejich signální potenciál zpětně na zavedeném modelu. Zkombinujeme výsledky prostorové transkriptomiky, histologie a funkční validace, abychom identifikovali soubor nejspolehlivějších markerových genů pro budoucí prognostické účely.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30204 - Oncology
OECD FORD - secondary branch
30206 - Otorhinolaryngology
OECD FORD - another secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology<br>FD - Oncology and haematology<br>FF - ENT (ie. ear, nose, throat), ophthalmology, dentistry
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 12, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MZ0-NW-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
15,032 thou. CZK
Public financial support
15,032 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK