Identification of Escherichia coli prognostic markers in colorectal cancer and evaluation of the neoplasia-associated strains ex vivo
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202400001
Main participants
Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NW25-09-00323
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace prognostických markerů Escherichia coli u kolorektálního karcinomu a ex vivo charakterizace kmenů asociovaných s neoplazií
Annotation in Czech
Kolorektální karcinom je jednou z nejčastějších malignit, přičemž etiopatogeneze tohoto onemocnění není kompletně objasněna. Nedávné studie ukázaly, že kromě genetické výbavy jedince a environmentálních faktorů hraje důležitou roli i složení střevního mikrobiomu. Pacienti s kolorektálním karcinomem jsou často kolonizováni specifickými populacemi Escherichia coli, které obvykle osidlují střevo člověka již v raném věku a jejich dlouhodobá přítomnost ve střevě tak může přispívat k chronickému zánětu a rozvoji kolorektální neoplázie. S rostoucími důkazy o dlouhodobém působení těchto kmenů E. coli na hostitele vzniká potřeba identifikovat genetické markery, které by umožnily odhalit přítomnost těchto kmenů E. coli ve střevě jedince. V naší předchozí studii jsme identifikovali čtyři geny E. coli asociované s výskytem neoplázie u pacientů. Cílem tohoto projektu je identifikace případných dalších markerů spojených s neoplazií sekvenací celých genomů E. coli z předchozí studie. Navíc budou všechny identifikované markery E. coli ověřeny ex vivo a prognostický potenciál jednotlivých markerů bude analyzován v prospektivní studii subjektů vyšetřených před deseti lety s využitím jejich lékařských záznamů od biopsie až po současnost. Na základě získaných výsledků bude v závěru projektu navržena metoda pro PCR skríning prognostických markerů neoplázie ve vzorcích stolice. Sledování přítomnosti prognostických markerů neoplázie pomocí PCR ve vzorku stolice je vhodné zejména pro rizikové skupiny (např. s rodinnou anamnézou), kterým umožní včasné rozpoznání vyššího rizika možného vzniku neoplazie.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2028
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MZ0-NW-R
Data delivery date
Apr 2, 2025
Finance
Total approved costs
15,441 thou. CZK
Public financial support
15,441 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK