Nation-wide information system of genetic evaluation of farm animals
Public support
Provider
Ministry of Agriculture
Programme
Comprehensive sustainable systems in agriculture 2012 ? 2018 ?CSS?
Call for proposals
Komplexní zemědělské systémy 3 (SMZE2015MZE01)
Main participants
Výzkumný ústav živočišné výroby, v.v.i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
83-2015-17012
Alternative language
Project name in Czech
Celostátní informační systém genetického hodnocení hospodářských zvířat
Annotation in Czech
Cílem je trvalý vývoj a průběžné uplatňování metod hodnocení plemenných zvířat v celostátním chovatelském informačním systému. Způsoby hodnocení zvířat se trvale prudce vyvíjí. Nové postupy jsou celosvětově téměř okamžitě zaváděny do provozu celostátních hodnocení zvířat. Včasné uplatnění co nejnovějších a nejpřesnějších postupů má ekonomické důsledky. Navrhovaný projekt je zaměřen na úpravu stávajících a vývoj nových matematicko-statistických postupů genetického hodnocení hospodářských zvířat, včetně genetických parametrů, vhodných pro výrobní podmínky ČR, postupů umožňujících napojení na celosvětové hodnocení (Interbull, Interbeef) a jejich uplatnění v celostátním chovatelském informačním systému.Řešení pokrývá hlavní druhy hospodářských zvířat. Cíle jsou obecné a jejich využití podle jednotlivých živočišných druhů: Vývoj algoritmů a metod řešení velkých soustav rovnic lineárních modelů se smíšenými pevnými a náhodnými efekty, váhami podle důležitosti vstupních fenotypových údajů, zohledněním vícerozměrných veličin, korelovaných maternálních efektů a kovariančních matic polynomů s náhodnými regresemi (random regression). Slučování rodokmenových a genomických informací, stanovení populačně-genetických parametrů se zahrnutím genomických údajů, včlenění mezinárodních údajů a spolehlivostí plemenných hodnot. Včlenění do celostátních informačních systémů.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
IN - Informatics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40203 - Husbandry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Based on the results of research activities (genomic evaluation, testing of new procedures of animal evaluation and their introduction in regular operation, including activities in international working committees) procedures of genetic evaluation of animals have been developed, the existing breeding information system has been further modified, especially by modification of algorithms of linear models, introduction of reliability programmes and international evaluation, input of genetic parameters and genetic evaluation and development of programmes solving large sets of equations with entering a huge number of genomic data. Throughout the period of investigation, instead of the original 15 outputs 49 outputs were obtained, of which most valued are 2 pieces of computer software and 3 certified methodologies.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-MZE-QJ-U/01:1
Data delivery date
Jun 25, 2019
Finance
Total approved costs
12,840 thou. CZK
Public financial support
10,213 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
2,627 thou. CZK