New approaches to the production of certified varieties of apple trees using NGS diagnostics of pathogens
Project goals
Implementation and evaluation of tests (PCR, ELISA, NGS) for the presence of viruses, viroids and phytoplasma in propagation materials of apple. Research and application of new sanitation techniques using promising antiviral substances, or cryo-knife. Confirmation of health status of sanitated cultivars including use of modern diagnostic methods such as sequencing of the new generation (NGS). Based on the obtained knowledge: 1. Acquire high-quality propagation material of apple cultivars with a qualitatively new knowledge of health status (presence of microorganisms) using NGS diagnostics. 2. Develop a certified methodology for the production of sanitated cultivars of apple using NGS. 3. Establish experimental pilot plantation of apple trees to verify research results.
Keywords
propagation materialfruitapplediseasesNGSpathogensanitationchemotherapycryo-knife
Public support
Provider
Ministry of Agriculture
Programme
Applied „ZEMĚ“ research programme of the Ministry of Agriculture for the period of 2017–2025
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zemědělství II 3 (SMZE2019MZE01)
Main participants
VÝZKUMNÝ A ŠLECHTITELSKÝ ÚSTAV OVOCNÁŘSKÝ HOLOVOUSY s.r.o.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
564-2018-14152
Alternative language
Project name in Czech
Nové přístupy k produkci ozdravených odrůd jabloní s využitím diagnostiky NGS patogenů
Annotation in Czech
Provedení a vyhodnocení testů (NGS a PCR) na přítomnost virů, viroidů a fytoplazem v rozmnožovacích materiálech jabloní. Výzkum a uplatnění nových postupů ozdravování s využitím perspektivních antivirotických látek, popřípadě kryonože. Potvrzení zdravotního stavu ozdravených odrůd včetně využití moderních diagnostických metody jako je sekvenování nové generace NGS. Na základě zjištěných poznatků: 1. Získat vysoce kvalitní rozmnožovací materiál odrůd jabloně s kvalitativně zcela novou znalostí o zdravotním stavu (přítomnosti mikroorganismů) při použití diagnostiky Nové Generace Sekvenování (NGS). 2. Vypracovat certifikovanou metodiku produkce ozdravených odrůd jabloně s využitím NGS. 3. Založit experimentální poloprovozní výsadbu jabloně pro ověření výsledků výzkumu.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project generated novel findings regarding new viruses and viroids in apple trees beyond the established EPPO Certification scheme, confirmed the potential of testing the health status of planting material by state-of-the-art NGS technologies and creating healthy varieties through biotechnological sanitation methods in in vitro cultures using antivirals. The results of the project are applicable to apple growing in the Czech Republic. Since it is one of the main fruit species, due attention shall be paid to potential pathogens. Health status of apple trees of Selena, Jonagored Supra, Champion, Golden Delicious, Boskoop red varieties and M9 rootstock for the preparation of planting material was improved.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 20, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZE-QK-U
Data delivery date
Jun 20, 2024
Finance
Total approved costs
15,557 thou. CZK
Public financial support
15,557 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
15 557 CZK thou.
Public support
15 557 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Agriculture
OECD FORD
Other agricultural sciences
Solution period
01. 01. 2019 - 31. 12. 2023